Kluczowa różnica między ORF a eksonem polega na tym, że ORF lub otwarta ramka odczytu to odcinek sekwencji DNA, który zaczyna się miejscem inicjacji translacji (kodon start) i kończy się miejscem terminacji translacji (kodon stop), podczas gdy ekson jest sekwencja nukleotydów w genie, który koduje aminokwasy.
Otwarta ramka do czytania jest częścią ramki do czytania. Ramki odczytu są odczytywane przez rybosomy w celu wytworzenia białek. ORF to ciągły ciąg kodonów, który daje w pełni funkcjonalne białko. Rozpoczyna się kodonem start i kończy kodonem stop. Wewnątrz ORF nie ma kodonu stop przerywającego sekwencję kodującą. Tłumaczenie zaczyna się od kodonu start i kończy na kodonie stop. Exon to sekwencja nukleotydowa genu. Koduje aminokwasy białka. Dlatego egzony są regionami kodującymi gen.
Co to jest ORF?
Otwarta ramka odczytu lub ORF to ciągły odcinek sekwencji nukleotydowej, który zaczyna się kodonem start i kończy kodonem stop. W prostych słowach ORF odnosi się do regionu sekwencji nukleotydowej znajdującej się między kodonami start i stop. W międzyczasie nie ma kodonu stop przerywającego ORF. Sekwencja nukleotydów pomiędzy kodonem start i stop koduje aminokwasy. Ogólnie kodon start to ATG, a kodony stop to TAG, TAA i TGA. ORF daje funkcjonalne białko po transkrypcji i translacji. Dlatego ORF zawiera kodon start, kilka kodonów w regionie środkowym i kodon stop. Co ciekawe, ORF ma długość, którą można podzielić przez trzy.
Rysunek 01: ORF
U prokariontów, ponieważ nie ma intronów, ORF jest regionem kodującym genu, który transkrybuje bezpośrednio do mRNA. U eukariontów, ponieważ istnieją introny, ORF jest sekwencją kodonów, która powstaje po obróbce lub splicingu RNA. ORF to dowód, który pomaga w przewidywaniu genów, ponieważ długie ORF mogą być częścią genu.
Co to jest egzon?
Eksony to kodujące sekwencje nukleotydowe genów, które przekładają się na białka. Znajdują się po obu stronach intronu. Po usunięciu sekwencji niekodujących z premRNA, dojrzała cząsteczka mRNA zawiera tylko sekwencje eksonowe. Następnie sekwencja nukleotydów końcowej cząsteczki RNA (dojrzałego mRNA) przekształca się w sekwencję aminokwasową określonego białka.
Rysunek 02: Eksony
Prawie wszystkie geny mają początkową sekwencję nukleotydową, która odróżnia go jako gen od głównej nici DNA lub RNA, znanej jako otwarta ramka odczytu (ORF. W niektórych genach, dwa ORF oznaczają cały gen i eksony znajdują się w sekwencji kodującej. Chociaż brzmi to, że eksony są zawsze wyrażane w genach, istnieją przypadki, w których sekwencje intronowe interweniują z egzonem, powodując mutacje, a proces ten jest znany jako egzonizacja.
Jakie są podobieństwa między ORF a egzonem?
- Zarówno ORF, jak i ekson są sekwencjami nukleotydowymi.
- Długie ORF i eksony są częścią genu.
- Oba mają sekwencje kodujące.
Jaka jest różnica między ORF a egzonem?
ORF i egzon to sekwencje nukleotydowe. ORF odnosi się do dowolnego odcinka sekwencji DNA znajdującego się pomiędzy kodonem start i kodonem stop. W przeciwieństwie do tego, egzon jest kodującą sekwencją nukleotydową genu, który koduje aminokwasy. Jest to więc kluczowa różnica między ORF a egzonem. Egzony są częścią genu, podczas gdy długa ORF jest prawdopodobnie częścią genu. Co więcej, po obu stronach egzonu znajdują się introny, podczas gdy ORF nie zawiera intronów.
Poniższa infografika podsumowuje różnicę między ORF a egzonem w formie tabelarycznej.
Podsumowanie – ORF kontra egzon
Otwarta ramka odczytu (ORF) jest częścią ramki odczytu. Jest to ciągły odcinek sekwencji DNA, który rozpoczyna się kodonem start i kończy kodonem stop. Exon to sekwencja nukleotydowa genu. Koduje część sekwencji mRNA. Dlatego eksony są częścią sekwencji genu, która ulega ekspresji w białku. W ten sposób podsumowuje różnicę między ORF a egzonem.
