Kluczowa różnica między sekwencją konserwatywną a sekwencją konsensusową polega na tym, że sekwencja konserwowana odnosi się do podobnych sekwencji kwasów nukleinowych lub aminokwasów, które występują w różnych lub tych samych gatunkach na przestrzeni pokoleń, podczas gdy sekwencja konsensusowa jest powszechnie spotykaną sekwencją nukleotydową lub sekwencją aminokwasową w wysoce konserwatywnym regionie DNA lub RNA lub białka.
Organizmy mają podobne, a także różne cechy. Przy badaniu relacji między organizmami i ich klasyfikowaniu bardzo ważny jest genom lub skład genetyczny organizmów. Istnieją pewne sekwencje nukleotydowe lub aminokwasowe, które są wspólne dla różnych organizmów. Konserwatywna sekwencja to sekwencja kwasu nukleinowego lub aminokwasowa, która jest zgodna wśród gatunków. Dlatego są one ważne filogenetycznie przy generowaniu drzew filogenetycznych. W konserwatywnych sekwencjach częściej spotyka się specyficzne sekwencje nukleotydowe. Są one znane jako sekwencje konsensusowe.
Co to jest zachowana sekwencja?
Konserwowana sekwencja to sekwencja kwasu nukleinowego lub sekwencja aminokwasowa podobna wśród gatunków. Dlatego jest spójny w całym gatunku w całej ewolucji. Ogólnie sekwencje te są utrzymywane przez dobór naturalny. Pozostają niezmienione daleko w górze drzewa filogenetycznego. Dlatego konserwatywne sekwencje są ważne w konstruowaniu drzew filogenetycznych. Uważa się, że wysoce konserwatywne sekwencje często mają ważną wartość funkcjonalną. Są również przydatne w identyfikacji chorób genetycznych. Jednak konserwatywne sekwencje mogą być kodującymi lub niekodującymi sekwencjami kwasu nukleinowego. Ponadto konserwatywne sekwencje wykazują wolniejsze tempo mutacji. W związku z tym wykazują bardzo minimalne zmiany w swoim składzie; czasami nie pokazują zmian na przestrzeni pokoleń.
Rysunek 01: Zachowana sekwencja
Składniki RNA rybosomów są obecne we wszystkich domenach życia, sekwencje homeoboxów u eukariotów i tmRNA w bakteriach to kilka przykładów wysoce konserwatywnych sekwencji. Identyfikacja konserwatywnych sekwencji jest łatwa, gdy stosuje się podejścia bioinformatyczne, zwłaszcza narzędzie do dopasowywania sekwencji. Co więcej, wyrównanie wielu sekwencji ułatwia wizualizację konserwatywnych sekwencji.
Co to jest sekwencja konsensusu?
Sekwencja konsensusowa to sekwencja powszechnie występująca w danym konserwatywnym regionie DNA lub RNA. To bardzo specyficzna sekwencja nukleotydów. Jako przykład, istnieje sekwencja konsensusowa przy -10 jako TATAAT (skrzynka Pribnowa) w promotorach E. coli, które są wysoce konserwatywnymi sekwencjami. Podobnie, istnieje inna sekwencja konsensusowa: TTGACA w promotorach E. coli również w pozycji -35. Sekwencje konsensusowe są również znane jako „pudełka”.
Rysunek 02: Sekwencja konsensusu
Oprócz DNA i RNA, białka mają również konsensusowe sekwencje aminokwasów. Miejsca wiązania białek są często reprezentowane przez sekwencje konsensusowe. Enzymy restrykcyjne mają również sekwencje konsensusowe. Ponadto miejsca splicingu są również sekwencjami konsensusowymi. Podobnie jak w przypadku konserwatywnych sekwencji, sekwencje konsensusowe mogą być obliczane i wizualizowane za pomocą narzędzi bioinformatycznych.
Jakie są podobieństwa między sekwencją zachowaną a sekwencją konsensusu?
- Konserwowane i konsensusowe sekwencje to sekwencje kwasów nukleinowych lub aminokwasów, które są wspólne dla wszystkich gatunków.
- Zarówno sekwencje konserwatywne, jak i konsensusowe mogą być wizualizowane przez narzędzia bioinformatyczne.
- Są szeroko stosowane w biologii molekularnej.
Jaka jest różnica między sekwencją zachowaną a sekwencją konsensusu?
Konserwowana sekwencja jest sekwencją kwasu nukleinowego lub aminokwasową, która jest spójna wśród gatunków, podczas gdy sekwencje konsensusowe są bardzo specyficznymi i powszechnie występującymi zasadami lub aminokwasami w danym konserwowanym regionie. Jest to więc kluczowa różnica między sekwencją konserwowaną a sekwencją konsensusową. Co więcej, inną różnicą między sekwencją konserwatywną a sekwencją konsensusową jest to, że sekwencje konserwowane są ważne filogenetycznie, podczas gdy sekwencje konsensusowe są często miejscami wiązania białek, miejscami splicingu, miejscami cięcia enzymów restrykcyjnych itp.
Podsumowanie – sekwencja konserwowana a sekwencja konsensusu
Konserwowane sekwencje to sekwencje kwasów nukleinowych lub białek, które są podobne u żywych gatunków. Promotor, miejsce wiązania rybosomu, początek replikacji i sekwencja aminokwasowa białka histonowego to kilka przykładów konserwatywnych sekwencji. W przeciwieństwie do tego, sekwencje konsensusowe są specyficznymi zasadami lub aminokwasami, które są częściej spotykane w danej konserwatywnej sekwencji. Kilka przykładów sekwencji konsensusowych to -10 box, -35 box promotora E. coli, miejsca wiązania białek, miejsca splicingu i miejsca rozpoznające enzymy restrykcyjne. Jest to zatem podsumowanie różnicy między sekwencją konserwowaną a sekwencją konsensusową.
