Kluczowa różnica – minisatelita a mikrosatelita
Powtarzające się DNA to sekwencje nukleotydowe powtarzające się w kółko w genomie organizmów. Powtarzające się DNA stanowi znaczną część genomowego DNA i istnieją trzy główne typy zwane powtórzeniami tandemowymi, powtórzeniami końcowymi i powtórzeniami przeplatanymi. Powtórzenia tandemowe to bardzo powtarzające się sekwencje, które leżą obok siebie bez przerwy. W genomie kręgowców istnieją trzy główne typy powtórzeń tandemowych. Są to DNA satelitarne, DNA mikrosatelitarne i DNA minisatelitarne. Minisatelita to odcinek wysoce powtarzalnego DNA, który składa się z serii powtarzających się sekwencji składających się z 10 do 100 par zasad. Mikrosatelita to odcinek powtarzającego się DNA, który składa się z krótkich, powtarzających się sekwencji składających się z 1 do 9 par zasad. Dlatego kluczową różnicą między minisatelitą a mikrosatelitą jest rozmiar lub długość powtarzającej się sekwencji.
Co to jest minisatelita?
Minisatellite DNA to odcinek DNA, który składa się z serii krótkich powtarzających się sekwencji DNA o długości od 10 do 60 par zasad. Minisatelity są również określane jako o zmiennej liczbie powtórzeń tandemowych (VNTR). Minisatelity są często mylone z mikrosatelitami. Jednak minisatelity i mikrosatelity są teraz rozróżniane przez naukowców na podstawie rozmiaru powtarzającej się sekwencji.
Minisatelity można zobaczyć w ponad 1000 miejscach ludzkiego genomu. Te krótkie sekwencje są bogate w G i C. Liczba powtórzeń w danym minisatelite jest bardzo zróżnicowana u poszczególnych osobników.
Pierwszy ludzki minisatelita został zidentyfikowany przez A. R. Wymana i R. White'a w 1980 roku. Później Alec Jeffreys odkrył ekstremalny polimorfizm liczby kopii minisatelitów wśród organizmów. Odkrycia te uczyniły minisatelity idealnymi markerami do pobierania odcisków palców DNA, analizy powiązań i badań populacyjnych. Minisatelity przyczyniają się również do regulacji ekspresji genów, transkrypcji, alternatywnego splicingu itp.
Co to jest mikrosatelita?
Mikrosatelita to odcinek DNA, który ma proste powtórzenia sekwencji o długości od 1 do 10 par zasad. Mikrosatelity są również nazywane powtórzeniami o krótkiej sekwencji (SSR) lub prostymi powtórzeniami tandemowymi (STR). Istnieją dwa rodzaje mikrosatelitów zwane mikrosatelitami prostymi i mikrosatelitami złożonymi. Proste mikrosatelity składają się tylko z jednego typu sekwencji powtórzeń. Mikrosatelity kompozytowe składają się z więcej niż jednego rodzaju powtórzeń. Mikrosatelity najczęściej posiadają regiony poli A/T. Mikrosatelity współdominują i występują w wielu genomach eukariotycznych.
Podobnie do minisatelitów, mikrosatelity również wykazują polimorfizm wśród osobników. Liczba powtórzeń dla danego mikrosatelity jest różna u poszczególnych osób. Dlatego mikrosatelity mogą być również wykorzystywane jako markery genetyczne w odciskach palców DNA. Polimorfizm mikrosatelitarny można łatwo zidentyfikować za pomocą PCR i elektroforezy żelowej. Obszar oskrzydlający mikrosatelity jest wysoce zachowany u spokrewnionych gatunków.
Jakie są podobieństwa między minisatelitą a mikrosatelitą?
- Minisatelity i mikrosatelity to niekodujące sekwencje DNA.
- Oba są powtórzeniami tandemowymi.
- Oba składają się z bardzo powtarzających się sekwencji.
- Oba mogą być używane jako potężne markery genetyczne do pobierania odcisków palców DNA.
Jaka jest różnica między minisatelitą a mikrosatelitą?
Minisatelita kontra mikrosatelita |
|
Minisatelity są powtórzeniami tandemowymi o długości powtórzeń monomeru od 10 do 100 par zasad. | Mikrosatelity to krótkie powtórzenia tandemowe, które składają się z 1 do 9 par zasad sekwencji powtórzeń monomeru. |
Rozmiar powtarzającej się sekwencji | |
Minisatelita posiada powtarzające się sekwencje od 10 do 100 par zasad. | Mikrosatelita ma krótkie sekwencje od 1 do 9 par zasad. |
Wspólne bazy | |
Minisatelity są bogate w zasady G i C. | Mikrosatelity są bogate w bazy A i T. |
Inne nazwy | |
Minisatelity są również znane jako powtórzenia tandemowe o zmiennej liczbie (VNTR). | Mikrosatelity są również znane jako krótkie powtórzenia sekwencji (SSR) lub proste powtórzenia tandemowe (STR). |
Podsumowanie – minisatelita kontra mikrosatelita
Minisatelita i mikrosatelita to dwa rodzaje powtórzeń tandemowych. Rozróżnia się je na podstawie liczby zasad w powtarzającej się sekwencji lub wielkości sekwencji. Minisatelita ma sekwencję powtarzającą się o długości od 10 do 100 par zasad, podczas gdy mikrosatelita ma sekwencję powtarzającą się o długości od 1 do 9 par zasad. To główna różnica między minisatelitą a mikrosatelitą. Liczba kopii powtarzającej się sekwencji w minisatelitach i mikrosatelitach różni się znacznie u poszczególnych osób. Zarówno minisatelity, jak i mikrosatelity są potężnymi markerami DNA do analizy zmienności genetycznej w obrębie populacji gatunków i między nimi.
Pobierz wersję PDF minisatelity kontra mikrosatelita
Możesz pobrać wersję PDF tego artykułu i używać jej do celów offline, zgodnie z notatkami dotyczącymi cytowań. Proszę pobrać wersję PDF tutaj Różnica między minisatelitą a mikrosatelitą.