Kluczowa różnica – ukorzenione vs nieukorzenione drzewo filogenetyczne
Filogeny to ważna dziedzina, która bada życie na ziemi w czasie. Ujawnia związek między organizmami z ich przodkami i potomkami. Relacje między organizmami są schematycznie reprezentowane przez różne reprezentacje drzewiaste, takie jak dendogram, kladogram, fenogram, filogram itp. Drzewo filogenetyczne to rozgałęziony diagram podobny do drzewa, który wyjaśnia relacje filogenetyczne między organizmami wraz z odległością ewolucyjną. Istnieją dwa główne typy drzew filogenetycznych, znane jako ukorzenione i nieukorzenione. Kluczowa różnica między ukorzenionym i nieukorzenionym drzewem filogenetycznym polega na tym, że ukorzenione drzewo pokazuje najbardziej podstawowego przodka drzewa, podczas gdy nieukorzenione drzewo filogenetyczne nie pokazuje korzenia przodka.
Co to jest zakorzenione drzewo filogenetyczne?
Ukorzenione drzewo filogenetyczne służy jako przydatny diagram, który pokazuje historię ewolucji. Ma podstawowy węzeł zwany korzeniem, reprezentujący wspólnego przodka wszystkich grup drzewa. Korzeń drzewa jest uważany za najstarszy punkt w drzewie, który reprezentuje ostatniego wspólnego przodka wszystkich grup wchodzących w skład drzewa. Dlatego ukorzenione drzewo wskazuje kierunek ewolucji. Z pojedynczego gatunku ukorzenionego drzewa, wspólnego przodka lub przodka gatunku można znaleźć, prześledząc wstecz do węzła podstawowego. Ponieważ ukorzenione drzewo przedstawia kierunek ewolucyjny, łatwo jest znaleźć starsze lub nowsze grupy, które ma. Drzewo ukorzenione może służyć do badania całych grup organizmów. Dokładne ukorzenienie drzewa filogenetycznego jest ważnym i kluczowym czynnikiem, ponieważ niedokładne ukorzenienie może skutkować błędną interpretacją zmian genetycznych między organizmami i ich kierunkowością ewolucji.
Rysunek 01: Zakorzenione drzewo filogenetyczne
Czym jest nieukorzenione drzewo filogenetyczne?
Niezakorzenione drzewo filogenetyczne to diagram filogenetyczny, w którym brakuje wspólnego przodka lub węzła podstawowego. Ten rodzaj drzewa nie wskazuje na pochodzenie ewolucji grup zainteresowań. Przedstawia tylko relacje między organizmami, niezależnie od kierunku ewolucyjnej linii czasu. Dlatego trudno jest badać ewolucyjne relacje grup względem czasu za pomocą nieukorzenionego drzewa.
Istnieją dwa główne sposoby ukorzenienia nieukorzenionego drzewa filogenetycznego. Są
Znalezienie outgroup – wymaga to wcześniejszej wiedzy na temat relacji między taksonami. Następnie takson leżący poza grupą może być użyty jako grupa zewnętrzna do narysowania zakorzenionego drzewa filogenetycznego
Znajdowanie punktu środkowego lub odległości – Punkt środkowy najbardziej odległych dwóch taksonów w drzewie można przyjąć jako korzeń drzewa filogenetycznego
Rysunek 02: Nieukorzenione drzewo filogenetyczne
Jaka jest różnica między ukorzenionym a nieukorzenionym drzewem filogenetycznym?
Zakorzenione vs nieukorzenione drzewo filogenetyczne |
|
| Zakorzenione drzewo filogenetyczne to diagram, który pokazuje ostatniego wspólnego przodka grup. | Nieukorzenione drzewo filogenetyczne pokazuje relacje między organizmami bez pokazywania wspólnego przodka. |
| Węzeł | |
| Ma węzeł (root). | Nie ma węzła. |
| Kierunek ewolucji | |
| Ma kierunek wskazujący czas ewolucji. | Nie określa relacji ewolucyjnej. |
| Stosunek do innych | |
| Drzewo pozwala na określenie relacji przodek – potomek między grupami. | Drzewo nie pozwala mówić o relacji przodek – potomek. |
Podsumowanie – zakorzenione vs nieukorzenione drzewo filogenetyczne
Drzewo filogenetyczne reprezentuje ścieżki ewolucyjne i połączenia między organizmami za pomocą rozgałęzionych diagramów przypominających drzewo. Drzewo filogenetyczne może być ukorzenione lub nieukorzenione. Zakorzenione drzewo ma u podstawy węzeł, reprezentujący wspólnego przodka, który łączy wszystkie grupy interesów. Nieukorzenione drzewo pokazuje relacje między organizmami. Nie przedstawia jednak wspólnego przodka, którego dzielą wszystkie grupy. To jest różnica między ukorzenionym i nieukorzenionym drzewem filogenetycznym.
