Kluczowa różnica między ligazą DNA T4 a ligazą DNA E. coli polega na tym, że ligaza DNA T4 jest enzymem izolowanym z bakteriofaga T4, podczas gdy ligaza DNA E. coli jest enzymem izolowanym z bakterii E. coli.
Ligaza DNA jest specyficznym rodzajem enzymu, który ułatwia łączenie nici DNA poprzez tworzenie wiązania fosfodiestrowego. Odgrywa ważną rolę poprzez naprawę pęknięć jednoniciowych i pęknięć dwuniciowych w DNA organizmów żywych. Ponadto ligaza DNA jest stosowana zarówno w naprawie, jak i replikacji DNA. Poza powyższymi zastosowaniami, ligaza DNA ma również szerokie zastosowanie w eksperymentach biologii molekularnej, takich jak technologia rekombinacji DNA. Ligaza DNA T4 i ligaza DNA E. coli to dwa typy enzymów ligazy DNA.
Co to jest ligaza DNA T4?
T4 ligaza jest enzymem łączącym DNA, który jest izolowany z bakteriofaga T4. Bakteriofag T4 to wirus infekujący Escherichia coli. Enzym ligazy T4 jest najczęściej stosowaną ligazą DNA w badaniach laboratoryjnych biologii molekularnej. Zwykle ligaza T4 katalizuje łączenie dwóch spójnych lub tępo zakończonych nici dwuniciowego DNA między grupami 5' fosforanowymi i 3' grupami hydroksylowymi sąsiednich nukleotydów. Może również katalizować łączenie RNA z nicią DNA lub RNA w cząsteczce dupleksu. Jednak ten enzym nie połączy się z jednoniciowymi kwasami nukleinowymi. Co więcej, może również ligować DNA z tępymi końcami ze znacznie większą wydajnością niż ligaza DNA E. coli.
Rysunek 01: Ligaza DNA T4
Ten enzym wymaga ATP jako kofaktora. Niektóre eksperymenty badawcze inżynierii genetycznej już wyprodukowały więcej aktywnych enzymów ligazy DNA niż ligaza DNA T4 typu dzikiego. W jednym z podejść stworzyli cząsteczkę enzymu fuzyjnego, łącząc ligazę DNA T4 z cząsteczką p50 lub NF-kB. Ten nowy enzym ligaza T4 był o 160% bardziej aktywny w ligacjach na tępe końce do celów klonowania niż ligaza DNA T4 typu dzikiego. Ponadto optymalna temperatura dla ligazy DNA T4 do dokładniejszego katalizowania reakcji ligacji wynosi 16°C.
Co to jest ligaza DNA E Coli?
E. Ligaza DNA coli jest enzymem wyizolowanym z bakterii E. coli. Gen odpowiedzialny za wytwarzanie ligazy DNA E. coli to gen lig. DNA E. coli, ligaza, jak również większość ligaz DNA prokariota, wykorzystują energię uzyskaną przez NAD (dinukleotyd nikotynoamidoadeninowy) do tworzenia wiązania fosfodiestrowego.
Rysunek 02: Ligaza DNA E. coli
E. Ligaza DNA coli jest enzymem ligacyjnym, który może łączyć fragmenty DNA poprzez katalizowanie tworzenia wiązań fosfodiestrowych między dwuniciowymi fragmentami DNA zawierającymi końce 5’ fosforanowe i końce 3’ hydroksylowe. Co więcej, nie liguje DNA z tępymi końcami, z wyjątkiem specjalnych warunków, takich jak zagęszczenie molekularne glikolem polietylenowym. Nie może również skutecznie łączyć RNA z DNA. Ponadto aktywność ligazy DNA E. coli może być wzmocniona przez obecność polimerazy DNA 1 w odpowiednim stężeniu. Jednakże, gdy stężenie enzymu polimerazy DNA 1 jest wyższe, ma to niekorzystny wpływ na aktywność ligazy DNA E. coli.
Jakie są podobieństwa między ligazą DNA T4 a ligazą DNA E Coli?
- Ligaza DNA T4 i ligaza DNA E-coli to dwa rodzaje enzymów ligazy DNA.
- Oba są białkami składającymi się z aminokwasów.
- Te enzymy katalizują tworzenie wiązania fosfodiestrowego między zestawionymi końcami 5’ fosforanowymi i 3’ hydroksylowymi w dupleksowym DNA.
- Mają szerokie zastosowanie w eksperymentach biologii molekularnej, takich jak technologia rekombinacji DNA.
Jaka jest różnica między ligazą DNA T4 a ligazą DNA E Coli?
T4 ligaza DNA jest enzymem wyizolowanym z bakteriofaga T4, podczas gdy ligaza DNA E. coli jest enzymem wyizolowanym z bakterii E. coli. Jest to zatem kluczowa różnica między ligazą DNA T4 a ligazą DNA E. coli. Ponadto źródłem energii dla ligazy DNA T4 jest ATP. Z drugiej strony źródłem energii dla ligazy DNA E. coli jest NAD.
Poniższa infografika przedstawia różnice między ligazą DNA T4 a ligazą DNA E coli w formie tabelarycznej do porównania.
Podsumowanie – Ligaza DNA T4 vs ligaza DNA E Coli
Ligaza DNA T4 i ligaza DNA E. coli to dwa enzymy, które katalizują tworzenie wiązania fosfodiestrowego między zestawionymi końcami 5’ fosforanu i 3’ w dupleksie DNA. Ligaza T4 jest enzymem izolowanym z bakteriofaga T4, podczas gdy ligaza DNA E. coli jest enzymem izolowanym z bakterii E. coli. Jest to więc kluczowa różnica między ligazą DNA T4 a ligazą DNA E coli.
