Kluczowa różnica między DNA wolnym od komórek a krążącym DNA nowotworu polega na tym, że DNA wolny od komórek to różne formy DNA, które swobodnie krążą we krwi, podczas gdy krążące DNA nowotworu to pofragmentowane DNA pochodzące z guza, które krąży we krwi.
DNA wolne od komórek i DNA krążącego guza to dwa rodzaje krążących kwasów nukleinowych. Krążące kwasy nukleinowe odkryli Mandel i Metal w 1948 roku. Później odkryto, że ilość krążących kwasów nukleinowych u chorych pacjentów jest znacząco wysoka. To odkrycie zostało po raz pierwszy dokonane w odniesieniu do pacjentów z toczniem. Ponadto krążące kwasy nukleinowe mają wyższą wartość prognostyczną i mogą być wykorzystywane jako biomarker do wykrywania różnych chorób.
Co to jest DNA wolne od komórek?
Bezkomórkowy DNA (Cf DNA) odnosi się do różnych form DNA, takich jak krążące DNA guza, bezkomórkowe mitochondrialne DNA i bezkomórkowe płodowe DNA itp., które swobodnie krążą we krwi. Podwyższony poziom wolnego od komórek DNA obserwuje się w zaawansowanych chorobach, takich jak rak, uraz, posocznica, zawał mięśnia sercowego, cukrzyca, udar, niedokrwistość sierpowatokrwinkowa itp. Oprócz raka i medycyny płodowej, wolne od komórek DNA jest użytecznym biomarkerem mnogość dolegliwości. Ten DNA można również wykorzystać do wykrywania odrzucenia przeszczepu. Są one również używane do określania zwykłego stresu, prenatalnego rozpoznawania płci oraz badania ojcostwa.
Rysunek 01: DNA bez komórek
DNA wolne od komórek to zwykle dwuniciowa pozakomórkowa cząsteczka DNA. Składa się z małych fragmentów (50 do 200 pz) i większych fragmentów (21 kb). Co więcej, został już uznany za wiarygodny biomarker do diagnozowania raka prostaty i piersi. Wolne od komórek DNA krąży głównie w krwiobiegu jako nukleosomy. Nukleosomy to jądrowe kompleksy histonów i DNA. Cf DNA można oznaczać ilościowo przy użyciu różnych technik, takich jak PCR, masowo równoległe sekwencjonowanie, spektrometria w ultrafiolecie, barwienie PicoGreen i ELISA. Ponieważ wykrywanie Cf DNA w krwiobiegu jest szybką, łatwą, nieinwazyjną i powtarzalną metodą, w przyszłości będzie potencjalnym biomarkerem do diagnozowania wielu chorób, takich jak autoimmunologiczne choroby reumatyczne i nowotwory.
Co to jest krążące DNA guza?
DNA krążącego guza (Ct DNA) to pofragmentowane DNA pochodzące z guza, które krąży we krwi. Ma pochodzenie nowotworowe. Ponieważ krążący guz może odzwierciedlać cały genom guza, zyskał dużą atrakcyjność ze względu na swoją potencjalną użyteczność w konfiguracjach klinicznych. Biopsje płynne, z których pobierana jest krew, mogą być wykorzystywane do badania guzów krążących.
Rysunek 02: Krążące DNA guza
Procesy biologiczne, które prawdopodobnie biorą udział w uwalnianiu DNA Ct, obejmują apoptozę i martwicę z umierających komórek lub aktywne uwalnianie z komórek nowotworowych. W zdrowych tkankach naciekające fagocyty mogą usunąć Ct DNA. Ponadto do analizy krążącego DNA guza można zastosować różne techniki, takie jak cyfrowy PCR kroplowy, BEAMing, CAPP-Seq (głębokie sekwencjonowanie), bezpieczne sekwencjonowanie i sekwencjonowanie dupleksowe.
Jakie są podobieństwa między DNA bezkomórkowym a DNA krążącego guza?
- DNA wolne od komórek i DNA krążącego guza to dwa rodzaje krążących kwasów nukleinowych.
- Składają się z nukleotydów.
- Oba typy mogą być używane jako potencjalne markery do diagnozowania różnych chorób w warunkach klinicznych.
- Znajdują się w krwiobiegu.
- Obie są pozakomórkowe formy cząsteczek DNA.
- Oboje są oczyszczane przez infiltrację fagocytów.
Jaka jest różnica między DNA bezkomórkowym a DNA krążącego guza?
DNA wolne od komórek to różne formy DNA, takie jak krążące DNA guza, bezkomórkowe mitochondrialne DNA i bezkomórkowe DNA płodowe itp., które swobodnie krążą we krwi, podczas gdy krążące DNA guza jest pofragmentowanym DNA pochodzącym z guza który krąży we krwi. To jest kluczowa różnica między DNA wolnym od komórek a DNA krążącego guza. Ponadto, wolne od komórek DNA krąży we fragmentach od 50-220 pz, podczas gdy krążące DNA guza krąży we fragmentach od 134-144 pz.
Poniższa infografika przedstawia różnicę między DNA wolnym od komórek a DNA krążącego guza w formie tabelarycznej do porównania.
Podsumowanie – DNA wolne od komórek a DNA krążącego nowotworu
Krążące kwasy nukleinowe są wrzucane do krwiobiegu poprzez regulowane lub przypadkowe mechanizmy. Wolne od komórek DNA i krążące DNA guza to dwa rodzaje krążących kwasów nukleinowych. Wolne od komórek DNA to różne formy DNA, takie jak krążące DNA guza, wolne od komórek DNA mitochondrialne, wolne od komórek DNA płodowe, które swobodnie krąży we krwi, podczas gdy krążące DNA guza to pofragmentowane DNA pochodzące z guza, które krąży we krwi. W ten sposób podsumowuje różnicę między DNA wolnym od komórek a DNA krążącego guza.
