Kluczowa różnica między enzymami restrykcyjnymi EcoRI i Hindlll polega na tym, że EcoRI jest enzymem restrykcyjnym typu II wyizolowanym z E. coli, podczas gdy Hindlll jest enzymem restrykcyjnym typu II wyizolowanym z Haemophilus influenza.
Enzym restrykcyjny lub endonukleaza restrykcyjna to enzym, który tnie DNA na fragmenty w określonych miejscach rozpoznania (miejscach restrykcyjnych) w cząsteczce DNA. Te enzymy restrykcyjne znajdują się w bakteriach i archeonach. Zapewniają mechanizm obronny przed atakującymi wirusami. Enzymy restrykcyjne dzieli się na pięć różnych typów: typ I, typ II, typ III, IV i typ V. EcoRI i Hindlll to dwa enzymy restrykcyjne należące do grupy enzymów restrykcyjnych typu II.
Co to są enzymy ograniczające EcoRI?
EcoRI to enzym restrykcyjny typu II wyizolowany z gatunków E.coli. Jest to enzym restrykcyjny, który rozcina podwójne helisy DNA na fragmenty w określonych miejscach. EcoRI jest również częścią systemu restrykcji-modyfikacji. EcoRI był pierwszym enzymem, który został pierwotnie wyizolowany ze szczepu RY13 gatunku E. coli. Jest stosowany jako enzym restrykcyjny w biologii molekularnej. EcoRI tworzy lepkie końce 4 nukleotydów z nawisami końca 5' AATT. EcoRI tnie DNA w określonej sekwencji rozpoznawczej G↓AATTC. Ma palindromiczną komplementarną sekwencję CTTAA↓G. Ponadto ten enzym restrykcyjny należy do podklasy typu II P (specyficzność palindromiczna). W swojej strukturze pierwszorzędowej EcoRI zawiera motyw PD. D/EXK w swoim miejscu aktywnym, podobnie jak wiele innych enzymów restrykcyjnych.
Rysunek 01: EcoRI
Enzym restrykcyjny EcoRI jest homodimerem o masie 31 kDa. Zawiera jedną domenę kulistą o architekturze α/β. Każda podjednostka zawiera pętlę, która wystaje z domeny kulistej i po związaniu otacza DNA. Enzym ten może być kokrystalizowany z sekwencją, którą normalnie tnie. Co więcej, enzym restrykcyjny EcoRI jest stosowany w wielu różnych technikach genetyki molekularnej, w tym w klonowaniu, przeszukiwaniu DNA i delecji odcinków DNA w warunkach in vitro.
Czym są enzymy restrykcyjne HindIII?
HindIII to enzym restrykcyjny typu II, wyizolowany z gatunku Haemophilus influenza. Rozszczepia on sekwencję palindromową DNA AACCTT w obecności kofaktora Mg2+ poprzez hydrolizę. Rozszczepienie tej konkretnej sekwencji między AA (5’A↓ACCTT3’ i 3’TTCGA↓A5’) skutkuje nawisami 5’ na cząsteczce DNA zwanych lepkimi końcami. Enzym ten znajduje się w organizmach prokariotycznych, takich jak bakterie. Bakterie wykorzystują ten enzym jako mechanizm obronny przed wirusami, takimi jak bakteriofagi.
Rysunek 02: HindIII
Strukturalnie HindIII jest homodimerem. Zawiera wspólny rdzeń strukturalny składający się z czterech arkuszy β i pojedynczej helisy α, podobnie jak inne typy enzymów restrykcyjnych II. Masa cząsteczkowa tego enzymu wynosi 34,9 kDa. Ponadto HindIII jest bardzo przydatny w nowoczesnych eksperymentach z dziedziny biologii molekularnej, takich jak sekwencjonowanie i mapowanie DNA.
Jakie są podobieństwa między enzymami restrykcyjnymi EcoRI i HindIII?
- EcoRI i Hindlll to dwa enzymy restrykcyjne należące do grupy enzymów restrykcyjnych typu II.
- EcoRI i HindIII zostały odkryte na początku lat 70.
- EcoRI i Hindlll zawierają motyw sekwencji aminokwasowej PD.. D/EXK.
- Oba enzymy restrykcyjne wykonują bardzo specyficzne cięcie DNA.
- Te enzymy restrykcyjne potrzebują Mg2+ jako kofaktora dla ich specyficznej aktywności.
- Po przecięciu DNA produkują lepkie końce.
- Są bardzo przydatnymi składnikami we współczesnych badaniach biologii molekularnej.
Jaka jest różnica między enzymami restrykcyjnymi EcoRI i HindIII?
EcoRI jest enzymem restrykcyjnym typu II wyizolowanym z gatunku E.coli, podczas gdy Hindlll jest enzymem restrykcyjnym typu II wyizolowanym z gatunku Haemophilus influenza. Jest to więc kluczowa różnica między EcoRI i HindIII. Ponadto EcoRI tnie DNA o określonej sekwencji rozpoznawania G↓AATTC, podczas gdy HindIII tnie DNA o określonej sekwencji rozpoznawania A↓ACCTT.
Poniższa infografika przedstawia różnice między EcoRI i HindIII w formie tabelarycznej do bezpośredniego porównania.
Podsumowanie – EcoRI kontra enzymy restrykcyjne HindIII
EcoRI i Hindlll to dwa enzymy restrykcyjne należące do podklasy p typu II. Dokonują bardzo specyficznego cięcia DNA. EcoRI jest enzymem restrykcyjnym typu II, który jest izolowany z gatunku E.coli, podczas gdy Hindlll jest enzymem restrykcyjnym typu II, który jest izolowany z gatunku Haemophilus influenza. To podsumowuje różnicę między EcoRI i HindIII.
