Kluczowa różnica między uzgodnionym i sekwencyjnym modelem allosteryzmu polega na tym, że w trybie uzgodnionym podjednostki enzymu są połączone w taki sposób, że zmiana konformacyjna w jednej podjednostce jest koniecznie nadana wszystkim innym podjednostkom, podczas gdy w modelu sekwencyjnym podjednostki nie są połączone w taki sposób, że zmiana konformacyjna w jednej podjednostce wywołuje podobną zmianę w innych.
Model uzgodniony i model sekwencyjny allosteryzmu można opisać jako dwa główne modele zachowania enzymów allosterycznych. Modele te zostały wprowadzone odpowiednio w 1965 i 1966 roku. Obecnie wykorzystujemy oba te modele jako podstawę do interpretacji wyników eksperymentalnych. Model uzgodniony ma tę zaletę, że jest stosunkowo prosty i bardzo dobrze opisuje zachowanie niektórych układów enzymatycznych. Z drugiej strony model sekwencyjny wykazuje pewną prostotę, ale tylko dla niektórych realistycznych obrazów struktur i zachowania białek. Ten tryb bardzo dobrze radzi sobie również z zachowaniem niektórych systemów enzymatycznych.
Jaki jest skoordynowany model allosteryzmu?
Uzgodniony model allosteryzmu zakłada, że podjednostki enzymu są połączone w taki sposób, że zmiana konformacyjna w jednej podjednostce jest z konieczności nadana wszystkim innym podjednostkom. Jest to również znane jako model symetrii lub model MWC. Zgodnie z tym modelem wszystkie podjednostki muszą istnieć w tej samej konformacji.
Rysunek 01: Regulacja allosteryczna (A – Miejsce aktywne B – Miejsce allosteryczne C – Substrat D – Inhibitor E – Enzym)
Ten model został wprowadzony przez Jacquesa Monoda, Jeffriesa Wymana i Jean-Pierre'a w 1965 roku. Zgodnie z tym modelem białko ma dwie konformacje: aktywną konformację R i nieaktywną konformację T. Konformacja R ściśle wiąże substrat, podczas gdy, w konformacji T, podłoże jest słabiej związane.
Jedną z wyróżniających cech modelu uzgodnionego jest to, że konformacja wszystkich podjednostek zmienia się jednocześnie. Na przykład, w hipotetycznym białku mającym dwie podjednostki, obie podjednostki mogą zmienić konformację z nieaktywnej konformacji T na aktywną konformację R.
Jaki jest sekwencyjny model allosteryzmu?
Sekwencyjny model allosteryzmu można opisać jako bezpośredni sekwencyjny model zachowania allosterycznego. Model ten ma wyróżniającą cechę wiązania substratu, który indukuje zmianę konformacyjną z formy T do formy R. Doprowadziło to do powstania kooperatywnej wiążącej ekspresji tego modelu.
Rysunek 02: Model sekwencyjny
Co więcej, w tym modelu wszystkie aktywatory i inhibitory są związane mechanizmem indukowanego dopasowania. Tutaj zmiana konformacyjna inhibitora lub aktywatora w jednej z podjednostek wpływa na konformacje innych podjednostek.
Najważniejsze cechy modelu sekwencyjnego to: jego podjednostki nie muszą istnieć w tej samej konformacji, jego zmiany konformacyjne nie są nadawane wszystkim podjednostkom, a cząsteczki substratów wiążą się za pomocą protokołu indukowanego dopasowania.
Jaka jest różnica między skoordynowanym a sekwencyjnym modelem allosteryzmu?
Kluczowa różnica między uzgodnionym i sekwencyjnym modelem allosteryzmu polega na tym, że w trybie uzgodnionym zmiana konformacyjna w jednej podjednostce jest koniecznie przekazywana do wszystkich innych podjednostek, podczas gdy w modelu sekwencyjnym zmiana konformacyjna w jednej podjednostce nie wywołać podobną zmianę u innych.
Podsumowanie – skoordynowany vs sekwencyjny model allosteryzmu
Uzgodniony model allosteryzmu to model, który zakłada, że podjednostki enzymu są połączone w taki sposób, że zmiana konformacyjna w jednej podjednostce jest z konieczności nadana wszystkim innym podjednostkom. Sekwencyjny model allosteryzmu jest bezpośrednim sekwencyjnym modelem zachowania allosterycznego. W tym modelu zmiana konformacyjna w jednej podjednostce nie wywołuje podobnej zmiany w pozostałych. Jest to więc kluczowa różnica między modelem skoordynowanym a sekwencyjnym allosteryzmu.
