Kluczowa różnica między endonukleazą restrykcyjną a egzonukleazą polega na tym, że endonukleaza restrykcyjna jest enzymem nukleazy, który rozpoznaje określoną sekwencję DNA i tnie DNA w obrębie lub w sąsiedztwie tej sekwencji, podczas gdy egzonukleaza jest enzymem nukleazy, który rozcina nukleotydy w polinukleotyd od końca 5' lub końca 3' pojedynczo.
Nukleazy to enzymy, które rozcinają wiązania fosfodiestrowe między nukleotydami kwasów nukleinowych. W żywych organizmach są niezbędnymi narzędziami w wielu aspektach naprawy DNA w komórce. Defekty tych enzymów mogą powodować niestabilność genetyczną i niedobór odporności. Nukleazy restrykcyjne to specyficzne nukleazy, których działanie zależy od określonej sekwencji nukleotydowej. Przykładem jest endonukleaza restrykcyjna. Istnieje podstawowa klasyfikacja nukleaz oparta na lokalizacji aktywności, takich jak endonukleaza i egzonukleaza. Endonukleaza trawi regiony w środku docelowej cząsteczki DNA. Egzonukleaza trawi kwasy nukleinowe z końców. Stąd endonukleaza restrykcyjna i egzonukleaza to dwa rodzaje enzymów nukleazowych.
Co to jest endonukleaza restrykcyjna?
Endonukleaza restrykcyjna to enzym nukleaza, który rozpoznaje określoną sekwencję DNA i tnie DNA w obrębie lub w sąsiedztwie tej sekwencji. Specyficzna sekwencja DNA jest znana jako miejsce restrykcyjne. Jest również nazywany enzymem restrykcyjnym lub restryktazą. Endonukleaza restrykcyjna jest bardzo specyficznym enzymem. Jest to jedna z klas szerszej grupy enzymów endonukleaz. Endonukleazy restrykcyjne dzieli się powszechnie na pięć typów, które różnią się budową i zdolnością do cięcia substratu DNA w miejscu rozpoznania. Pięć typów to typ I, typ II, typ III, typ IV i typ V.
Rysunek 01: Endonukleaza restrykcyjna
Endonukleazy restrykcyjne zwykle znajdują się w bakteriach i archeonach. Zapewniają mechanizm obronny bakterii przed wirusami. Istnieje ponad 3600 znanych endonukleaz restrykcyjnych. Reprezentują ponad 250 różnych specyfików. Ponad 3000 z nich zostało szczegółowo zbadanych. Ponadto ponad 800 z nich jest dostępnych na rynku.
Co to jest egzonukleaza?
Egzonukleaza to enzym nukleaza, który odcina nukleotydy w polinukleotydzie pojedynczo z końca 5’ lub 3’. Dzieje się to poprzez reakcję hydrolizy, która rozrywa wiązania fosfodiestrowe między nukleotydami na końcu. Eukarionty i prokarionty mają trzy rodzaje egzonukleaz. Te egzonukleazy biorą udział w normalnym obrocie mRNA. Są to egzonukleazy od 5’ do 3’ (Xrn1), od 3’ do 5’ i egzonukleazy specyficzne dla poli-A od 3’ do 5’. Egzonukleaza od 5’ do 3’ jest białkiem zależnym od dekapowania. Egzonukleaza 3’ do 5’ jest niezależnym białkiem. Egzonukleaza specyficzna dla poli-A od 3’ do 5’ jest również znana jako rybonukleaza specyficzna dla poli-A zaangażowana w egzonukleolityczną degradację ogona poli-A.
Rysunek 02: Egzonukleaza
W archeonach i eukariotach degradacja RNA jest dokonywana przez wielobiałkowy kompleks egzosomów, który składa się z 3’ do 5’ egzorybonukleaz.
Jakie są podobieństwa między endonukleazą restrykcyjną a egzonukleazą?
- Restrykcyjna endonukleaza i egzonukleaza to dwa rodzaje enzymów nukleaz.
- Oba enzymy tną cząsteczki DNA.
- Te enzymy znajdują się u prokariontów.
- Są białkami.
Jaka jest różnica między endonukleazą restrykcyjną a egzonukleazą?
Endonukleaza restrykcyjna to enzym nukleaza, który rozpoznaje określoną sekwencję DNA i tnie DNA w obrębie lub w sąsiedztwie tej sekwencji, podczas gdy egzonukleaza to enzym nukleaza, który odcina nukleotydy w polinukleotydzie od końca 5' lub 3' pojedynczo. Jest to więc kluczowa różnica między endonukleazą restrykcyjną a egzonukleazą. Co więcej, endonukleaza restrykcyjna występuje tylko u prokariontów, podczas gdy egzonukleaza występuje zarówno u prokariontów, jak i eukariontów.
Poniższa infografika przedstawia różnice między endonukleazą restrykcyjną a egzonukleazą w formie tabelarycznej do bezpośredniego porównania.
Podsumowanie – Endonukleaza restrykcyjna a egzonukleaza
Nukleazy to enzymy, które rozrywają wiązania fosfodiestrowe między nukleotydami kwasów nukleinowych. Endonukleaza restrykcyjna i egzonukleaza to dwa rodzaje enzymów nukleazowych. Endonukleaza restrykcyjna jest enzymem nukleazy, który rozpoznaje określoną sekwencję DNA i tnie DNA w obrębie lub w sąsiedztwie tej sekwencji. Egzonukleaza jest enzymem nukleazy, który odcina nukleotydy w polinukleotydzie od ich końca 5' lub 3' po jednym na raz. Tak więc podsumowuje to różnicę między endonukleazą restrykcyjną a egzonukleazą.
