Kluczowa różnica między CDS a cDNA polega na tym, że CDS lub sekwencja kodująca jest częścią transkryptu, która jest faktycznie tłumaczona na białko, podczas gdy sekwencja cDNA jest sekwencją DNA pochodzącą z mRNA przez odwrotną transkrypcję.
Gen to sekwencja nukleotydowa, która koduje białko. Składa się z różnych regionów, takich jak region promotora, miejsce inicjacji transkrypcji, eksony, kodon start, introny i kodon stop. Dlatego gen ma zarówno sekwencje kodujące, jak i niekodujące. Sekwencje kodujące lub CDS odnoszą się do eksonów i dwóch kodonów, które są kodonem start i kodonem stop. Jest to sekwencja, która jest faktycznie tłumaczona na białko. W przeciwieństwie, cDNA jest sekwencją DNA pochodzącą z mRNA przez odwrotną transkrypcję.
Co to jest CDS?
CDS lub sekwencja kodująca jest częścią genu, który jest faktycznie tłumaczony na białko. Składa się z eksonów i dwóch kodonów, takich jak kodon AUG i kodon stop. W przeciwieństwie do cDNA, CDS nie zawiera dwóch nieulegających translacji regionów: 5’UTR i 3”UTR. Co więcej, introny nie są zawarte w CDS.
Rysunek 01: Sekwencja kodowania
W porównaniu z całym genomem i osobnikiem sekwencje kodujące stanowią niewielką część. Sekwencja kodująca składa się z niezbędnej sekwencji nukleotydowej do utworzenia sekwencji aminokwasowej białka.
Co to jest cDNA?
cDNA lub komplementarny DNA to sekwencja DNA wytworzona z sekwencji mRNA. Jest syntetyzowany w procesie zwanym odwrotną transkrypcją. Enzym odwrotnej transkryptazy katalizuje syntezę cDNA, a sekwencja mRNA działa jako matryca do syntezy cDNA. Zasadniczo mRNA komórek eukariotycznych można ekstrahować i oczyszczać w celu wytworzenia cDNA. Po skonstruowaniu cDNA z mRNA można je następnie sklonować do komórki bakteryjnej w celu stworzenia bibliotek cDNA. Biblioteki cDNA są ważne dla analizy regionów kodujących, funkcji genów i ekspresji genów itp.
Rysunek 02: cDNA
W przeciwieństwie do sekwencji kodującej, cDNA zawiera dwa UTR, które są 3’UTR i 5’UTR. Podobnie do sekwencji kodującej, cDNA nie zawiera intronów.
Jakie są podobieństwa między CDS a cDNA?
- CDS i cDNA to kwasy nukleinowe.
- Są wykonane z deoksyrybonukleotydów.
- Zarówno CDS, jak i CDNA nie zawierają intronów, które są regionami niekodującymi.
- Oba zawierają kod genetyczny lub informacje potrzebne do produkcji białka.
Jaka jest różnica między CDS a cDNA?
CDS lub sekwencja kodująca to część genu, która jest faktycznie tłumaczona na białko. Z drugiej strony sekwencja cDNA to sekwencja DNA uzyskana z mRNA przez odwrotną transkrypcję. To jest kluczowa różnica między CDS a cDNA. Poza tym CDS składa się z eksonów i dwóch kodonów, które są kodonem start i kodonem stop. W przeciwieństwie, cDNA składa się z pełnej sekwencji mRNA i dwóch UTR.
Co więcej, synteza cDNA odbywa się sztucznie z mRNA poprzez odwrotną transkrypcję, podczas gdy CDS znajdują się w genomowym DNA.
Poniższa infografika pokazuje więcej porównań, aby dostrzec różnicę między CDS a cDNA.
Podsumowanie – CDS vs cDNA
Sekwencja kodująca i cDNA to dwa rodzaje sekwencji nukleotydowych. Sekwencja kodująca znajduje się w genie, podczas gdy cDNA jest syntetyzowany sztucznie. Sekwencja kodująca ma eksony i dwa kodony, podczas gdy cDNA ma sekwencję mRNA i dwa UTR. Zarówno CDS, jak i cDNA mają tylko te sekwencje nukleotydowe, które faktycznie przekładają się na białko. Nie zawierają intronów. W przeciwieństwie do CDS, proces syntezy cDNA wymaga enzymu odwrotnej transkryptazy. Ponadto cDNA można konwertować do bibliotek cDNA. W ten sposób podsumowuje różnicę między CDS a cDNA.
