siRNA kontra miRNA
RNA to bardzo ważne cząsteczki, które pomagają budować życie organizmów. Niedawno naukowcy odkryli małe RNA zwane interferencją RNA lub RNAi, które działają po transkrypcji, aby kontrolować ekspresję genów. Dwa główne typy małych RNA to mikroRNA lub miRNA oraz małe interferujące RNA lub siRNA. Cząsteczki te zasadniczo regulują ekspresję genu poprzez tłumienie genu docelowego. Zarówno miRNA, jak i siRNA mają bardzo podobne szlaki biogenezy, chociaż istnieją między nimi pewne różnice. Pochodzenie miRNA i siRNA pochodzi z cząsteczek dsRNA. Dojrzałe miRNA są strukturalnie podobne do cząsteczek siRNA.
miRNA
Mikro RNA lub miRNA to małe cząsteczki RNA, które pośredniczą w końcowej kontroli w regulacji genu translacyjnego. Deregulacja miRNA może prowadzić do rozwoju raka i innych chorób. Dlatego właściwa regulacja informacji zakodowanej w niekodującym regionie miRNA jest bardzo krytyczna w wielu podstawowych procesach komórkowych.
siRNA
siRNA są również określane jako krótkie interferujące lub wyciszające RNA i składają się z dwuniciowego RNA z 20 do 25 parami zasad. Główną rolą siRNA jest zakłócanie ekspresji określonych genów o komplementarnych sekwencjach nukleotydowych. siRNA składa się z krótkich dwuniciowych RNA z fosforylowanymi końcami 5’ i hydroksylowanymi końcami 3’ z dwoma wystającymi nukleotydami.
Jaka jest różnica między siRNA a miRNA?
• miRNA pochodzące z określonych loci genomowych, natomiast siRNA pochodzące z mRNA, transpozonów, wirusów lub heterochromatycznego DNA.
• Synteza miRNA jest przetwarzana z dłuższych prekursorowych transkryptów spinki do włosów (pierwotna jądrowa sekwencja miRNA przez endonukleazę RNazy III), podczas gdy siRNA jest przetwarzana z długich dwucząsteczkowych dupleksów RNA.
• Każda cząsteczka prekursora spinki do włosów miRNA wytwarza pojedynczy dupleks miRNA, podczas gdy każda cząsteczka prekursora siRNA wytwarza wiele dupleksów siRNA.
• sekwencje siRNA są rzadko konserwowane, podczas gdy sekwencje miRNA są dobrze konserwowane.
• Wszystkie zasady w siRNA przyczyniają się do jego specyficzności docelowej, podczas gdy tylko 5’ połowa miRNA przyczynia się do jego specyficzności docelowej.
• miRNA często wiąże się z nieulegającym translacji regionem 3’ docelowych transkryptów, podczas gdy siRNA tworzą komplementarny dupleks w dowolnym miejscu wzdłuż docelowego mRNA.
• miRNA określa „hetero-wyciszanie”, podczas gdy siRNA jest używane do „automatycznego wyciszania”.
• miRNA działa jako sygnał zapobiegający translacji, podczas gdy siRNA fizycznie zapobiega translacji.
