Kluczowa różnica między snRNA i snoRNA polega na tym, że snRNA obejmuje alternatywne składanie pre-mRNA, podczas gdy snoRNA obejmuje modyfikację rRNA i tRNA, edycję mRNA i wdrukowywanie genomu.
Małe RNA to polimerowe cząsteczki RNA, które składają się z mniej niż 200 nukleotydów. Zwykle są niekodujące. Istnieją wśród informacyjnych RNA, aby przenosić sygnały. Małe RNA pochodzą z doskonałego dwuniciowego RNA, który jest wytwarzany w wyniku działania zależnej od RNA polimerazy RNA. Małe RNA odgrywają ważną rolę w różnicowaniu komórek, wzroście i proliferacji, apoptozie, metabolizmie, migracji i obronie. Dlatego małe RNA są ważnymi i krytycznymi regulatorami rozwoju i fizjologii. Mały jądrowy RNA i mały jąderkowy RNA to dwie klasy małych cząsteczek RNA.
Co to jest snRNA?
Małe jądrowe RNA lub snRNA to klasa małych cząsteczek RNA znajdujących się w jądrze komórek eukariotycznych. Średnia długość snRNA wynosi około 150 nukleotydów. Polimeraza RNA II lub polimeraza RNA III transkrybują snRNA. Główną funkcją snRNA jest przetwarzanie wstępnego informacyjnego RNA w jądrze. Pomagają również regulować czynniki transkrypcyjne lub polimerazę RNA II i utrzymywać telomery.
Rysunek 01: Mechanizm działania małego RNA
Istnieją dwie klasy snRNA oparte na wspólnych cechach sekwencji i powiązanych czynnikach białkowych, takich jak białko LSm wiążące RNA. Dwie klasy to snRNA klasy Sm i snRNA klasy Lsm. SnRNA klasy Sm składa się z wysokiej zawartości urydyny U1, U2, U4, U4atac, U5, U7, U11 i U12. Polimeraza RNA II dokonuje transkrypcji snRNA klasy SM. Po transkrypcji pre-snRNA zwykle otrzymują w jądrze czapeczkę 7-metyloguanozyny 5’. Następnie są eksportowane do cytoplazmy przez pory jądrowe w celu dalszej obróbki. SnRNA klasy Lsm ma wysoką zawartość urydyny U6 i U6atac. Polimeraza RNA III dokonuje transkrypcji snRNA klasy Lsm i nie opuszcza jądra. Najczęstszymi składnikami ludzkiego snRNA są spliceosomalny RNA U1, spliceosomalny RNA U2, spliceosomalny RNA U4, spliceosomalny RNA U5 i spliceosomalny RNA U6.
Co to jest snoRNA?
Mały jąderkowy RNA lub snoRNA to klasa małych cząsteczek RNA, które kierują modyfikacjami chemicznymi w innych RNA, takich jak rybosomalny RNA, transferowy RNA i mały jądrowy RNA. Każda cząsteczka snoRNA jest powiązana z około czterema białkami rdzeniowymi w kompleksie RNA/białko podczas procesu modyfikacji. SnoRNA zawiera element antysensowny, który ma około 10-20 nukleotydów. Te zasady są komplementarne do sekwencji otaczającej nukleotydy, których celem jest modyfikacja w cząsteczce pre-RNA.
Rysunek 02: Małe jądrowe RNA
Istnieją dwie klasy snoRNA. Są to C/D box snoRNA i H/ACA box snoRNA. SnoRNA C/D box jest związane z metylacją, a snoRNA H/ACA box jest związane z pseudo-urydylacją. Każda cząsteczka snoRNA działa jako przewodnik dla jednej lub dwóch modyfikacji w docelowym RNA. SnoRNA C/D box zawiera dwa krótkie, konserwowane motywy sekwencji C i D, odpowiednio w pobliżu końców 5' i 3' snoRNA. Krótkie regiony składające się z 5 nukleotydów układają się powyżej kasety C i poniżej kasety D i tworzą strukturę trzpień-pudełko. To zbliża motywy C i D box. Struktura pnia jest ważna dla prawidłowej syntezy snoRNA i lokalizacji jąderka. SnoRNA H/ACA box ma strukturę drugorzędową, która składa się z dwóch spinek do włosów i dwóch jednoniciowych regionów. Jest to powszechnie znane jako struktura spinka-zawias-szpilka-ogon. SnoRNA pudełkowe H/ACA również składa się z dwóch konserwatywnych motywów H i ACA. Oba znajdują się w regionach jednoniciowych. Pudełko H znajduje się w zawiasie, a ACA w regionie ogona. Trzy nukleotydy tworzą koniec 3’ sekwencji.
Jakie są podobieństwa między snRNA a snoRNA?
- snRNA i snoRNA to małe RNA.
- Oba są obecne w komórkach eukariotycznych.
- Oba są niekodującymi cząsteczkami RNA.
- Ponadto uczestniczą w modyfikowaniu RNA podczas procesu transkrypcji.
Jaka jest różnica między snRNA a snoRNA?
snRNA uczestniczy w alternatywnym splicingu pre-mRNA, podczas gdy snoRNA modyfikuje głównie cząsteczki RNA. Jest to więc kluczowa różnica między snRNA a snoRNA. Ponadto snRNA mają długość około 150 nukleotydów i często są połączone z grupą białek i kompleksów zwanych małymi rybonukleoproteinami jądrowymi. snoRNA mają długość około 60-170 nukleotydów i znajdują się głównie w jąderku.
Ponadto, snRNA są transkrybowane przez polimerazę RNA II lub polimerazę RNA III, podczas gdy snoRNA jest transkrybowane tylko przez polimerazę RNA II.
Poniższa infografika przedstawia różnice między snRNA i snoRNA w formie tabelarycznej do bezpośredniego porównania.
Podsumowanie – snRNA kontra snoRNA
snRNA i snoRNA to klasy małych cząsteczek RNA. snRNA uczestniczy w alternatywnym splicingu pre-mRNA, podczas gdy snoRNA modyfikuje głównie cząsteczki RNA. Jest to więc kluczowa różnica między snRNA a snoRNA. Małe RNA to polimeryczne cząsteczki RNA, które składają się z mniej niż 200 nukleotydów długości i zwykle nie kodują. snRNA znajdują się w jądrze eukariontów. snoRNA znajdują się w archeonach i eukariotach. Transkrypcja snRNA odbywa się za pośrednictwem polimerazy RNA II i II, podczas gdy tylko polimeraza RNA II bierze udział w transkrypcji snoRNA. To podsumowuje różnicę między snRNA a snoRNA.
