Kluczowa różnica między podjednostką białkową a domeną polega na tym, że podjednostka białkowa jest oddzielnym łańcuchem polipeptydowym białka, który łączy się z innymi łańcuchami polipeptydowymi, tworząc kompleks białkowy, podczas gdy domena białkowa jest ciągłym regionem łańcucha polipeptydowego białka, które często składa się niezależnie w zwartą, lokalną i częściowo niezależną jednostkę.
Podjednostka i domena białka są bardzo ważnymi częściami multimerycznego białka. Białka to polimery wytworzone z polipeptydów. Każdy łańcuch polipeptydowy składa się z monomeru znanego jako aminokwas. Złożone białko zawiera odrębne jednostki strukturalne, takie jak podjednostki, domeny, motyw i fałd. Te jednostki strukturalne złożonego białka są niezwykle ważne dla jego struktury, a ostatecznie dla jego funkcji.
Co to jest podjednostka białkowa?
Podjednostka białkowa to oddzielny łańcuch polipeptydowy białka, który łączy się z innymi łańcuchami polipeptydowymi, tworząc kompleks białkowy. W biologii strukturalnej podjednostka białka to pojedyncza cząsteczka białka, która łączy się z innymi cząsteczkami białka, tworząc kompleks białkowy. Naturalnie występujące białka mają stosunkowo niewielką liczbę podjednostek, takich jak hemoglobina i polimeraza DNA. Dlatego nazywa się je oligomerami. Inne białka składają się z dużej liczby podjednostek, dlatego określa się je jako multimeryczne. Na przykład mikrotubule i inne białka cytoszkieletu są multimeryczne. Podjednostki multimerycznego białka mogą być identyczne (homologiczne) lub całkowicie odmienne (heterologiczne).
Rysunek 01: Podjednostka białkowa
W niektórych białkach multimerycznych jedna podjednostka może być podjednostką katalityczną. Z drugiej strony, druga to podjednostka regulacyjna. Funkcją podjednostki katalitycznej jest katalizowanie reakcji enzymatycznej, natomiast funkcją podjednostki regulatorowej jest ułatwianie lub hamowanie jej aktywności. Enzym, który po złożeniu składa się zarówno z podjednostek katalitycznych, jak i regulatorowych, jest zwykle określany jako holoenzym. Na przykład, 3-kinaza fosfoinozytydu klasy I enzymu ma podjednostkę katalityczną p110 i podjednostkę regulatorową p85. Ponadto białko musi mieć jeden gen dla każdej podjednostki. Dzieje się tak, ponieważ podjednostka składa się z oddzielnego łańcucha polipeptydowego, który ma jeden gen kodujący.
Co to jest domena białkowa?
Domena białkowa jest ciągłym regionem łańcucha polipeptydowego białka, który często składa się niezależnie w zwarte, lokalne i częściowo niezależne jednostki. Domena białka jest również znana jako region łańcucha polipeptydowego białka, który ulega samostabilizacji i fałduje się niezależnie od reszty. Stanowią odrębną jednostkę strukturalną i funkcjonalną w białku. Zwykle domeny są odpowiedzialne za określoną funkcję lub interakcję, która przyczynia się do ogólnej roli białka. Na przykład domena SH3 ma około 50 reszt aminokwasowych. Występują w różnorodnych białkach, w tym białkach adaptorowych, kinazach fosfatydyloinozytolu3, fosfolipazach i miozynach. Te domeny SH3 biorą udział w interakcjach białko-białko.
Rysunek 02: Domeny białkowe
Domeny mają różną długość od 50 do 250 aminokwasów. Najkrótsze domeny, takie jak palec cynkowy, są stabilizowane przez jony metali i mostki dwusiarczkowe. Domena często wytwarza jednostki funkcjonalne, takie jak wiążąca wapń domena EF-hand kalmoduliny. Co więcej, domeny mogą być wymieniane za pomocą inżynierii genetycznej między jednym białkiem a drugim w celu wytworzenia białek chimerycznych.
Jakie są podobieństwa między podjednostką białka a domeną?
- Podjednostka i domena białka to jednostki strukturalne multimerycznego białka.
- Oba składają się z aminokwasów.
- Są one połączone z terminem „łańcuch polipeptydowy”.
- Ponadto oba są niezwykle ważne dla ogólnej funkcji białka.
Jaka jest różnica między podjednostką białka a domeną?
Podjednostka białkowa to oddzielny łańcuch polipeptydowy białka, który łączy się z innymi łańcuchami polipeptydowymi, tworząc kompleks białkowy. Z drugiej strony domena białkowa jest ciągłym regionem łańcucha polipeptydowego białka, który często fałduje się niezależnie w zwarte, lokalne i częściowo niezależne jednostki. To jest kluczowa różnica między podjednostką białka a domeną. Co więcej, podjednostka białkowa ma większy rozmiar niż domena białkowa.
Poniższa tabela podsumowuje różnicę między podjednostką białka a domeną w formie tabelarycznej.
Podsumowanie – podjednostka białkowa kontra domena
Cegiełkami budulcowymi białek są aminokwasy. Białka powstają w wyniku kondensacji aminokwasów. Struktury białkowe mają wielkość od dziesiątek do kilku tysięcy aminokwasów. Struktura białka jest stabilizowana przez oddziaływania niekowalencyjne, takie jak wiązania wodorowe, wiązania jonowe, siły Van der Waalsa, wiązania hydrofobowe i oddziaływania kowalencyjne, takie jak wiązania dwusiarczkowe. Złożone białko zawiera odrębne jednostki strukturalne, takie jak podjednostki, domeny, motyw i fałd. Podjednostka białkowa to oddzielny łańcuch polipeptydowy białka, który łączy się z innymi łańcuchami polipeptydowymi, tworząc kompleks białkowy. Z drugiej strony domena białkowa jest regionem łańcucha polipeptydowego białka, który ulega samostabilizacji i fałduje się niezależnie od reszty. Tak więc jest to podsumowanie różnicy między podjednostką białka a domeną.
