Kluczowa różnica między fikocyjaniną a allofikocyjaniną polega na tym, że fikocyjanina pochłania i emituje na krótszych falach niż allofikocyjanina.
Pykobiliproteiny to rodzina białek rozpuszczalnych w wodzie, które są obecne w sinicach i niektórych gatunkach alg. Fikocyjanina i allofikocyjanina to dwaj główni członkowie tej rodziny.
Co to jest fikocyjanina?
Fikocyjanina to kompleks pigmentowo-białkowy z rodziny fikobiliprotein zbierających światło. Innymi ważnymi członkami tej rodziny są allofikocyjanina i fikoerytryna. Ten pigment jest pigmentem pomocniczym do chlorofilu. Ogólnie rzecz biorąc, wszystkie fikobiliproteiny są rozpuszczalnymi w wodzie kompleksami, które nie mogą istnieć w błonach, tak jak karotenoidy. Zamiast istnieć w błonach, pigmenty te mają tendencję do agregacji, tworząc skupiska, które mogą przylegać do błon znanych jako fikobilisomy.
Rysunek 01: Ekstrahowane pigmenty fikocyjaniny (z cyjanobakterii)
Możemy zaobserwować, że fikocyjanina ma charakterystyczny jasnoniebieski kolor, który może absorbować światło pomarańczowe i czerwone (około 620 nm) i może emitować fluorescencję (około 650 nm). Ten barwny pigment możemy znaleźć w cyjanobakteriach, a nazwa „Fikocyjanina” pochodzi od greckiego znaczenia „Phyco”, które odnosi się do „glonów”, a sufiks „cyjanina” z greckiego znaczenia „Kyanos”, który odnosi się do „ciemnoniebieskiego”.
Zazwyczaj cząsteczki fikocyjaniny mają wspólną strukturę ze wszystkimi fikobiliproteinami. Rozważając strukturę tego pigmentu, zaczyna się od złożenia monomerów fikobiliproteiny. Te monomery są heterodimerami składającymi się z podjednostek alfa i beta z ich odpowiednimi chromoforami. Chromofory i podjednostki są połączone wiązaniem chemicznym tioeteru.
Podjednostki struktury fikocyjaniny zazwyczaj zawierają osiem alfa-helis. Struktury monomerów mają tendencję do spontanicznej agregacji, tworząc trimery w kształcie pierścienia, mające symetrię obrotową i kanał centralny. Co więcej, trimery mają tendencję do agregacji w parach, tworząc heksamery, które są wspomagane dodatkowymi białkami łącznikowymi. Dlatego każda pałeczka fikobilisomów zawiera dwa lub więcej heksamerów fikocyjaniny.
Co to jest allofikocyjanina?
Allofikocyjanina to cząsteczka białka, która pochodzi z rodziny fikobiliprotein i jest dodatkowym pigmentem chlorofilu. Inni członkowie tej rodziny fikobiliprotein zbierających światło obejmują fikocyjaninę, fikoerytrynę i fikoerytrocyjaninę. Pigmenty allofikocyjaniny mogą absorbować i emitować czerwone światło, a my możemy łatwo znaleźć ten pigment w sinicach i czerwonych algach.
Rysunek 02: Wygląd allofikocyjaniny na schemacie
Możemy wyizolować allofikocyjaninę z różnych gatunków alg czerwonych lub niebieskozielonych. Algi te wytwarzają nieco inne formy cząsteczki. Ogólnie rzecz biorąc, cząsteczka allofikocyjaniny zawiera dwie różne podjednostki nazwane jako podjednostka alfa i beta. Każda podjednostka ma jeden chromofor fikocyjanobiliny.
Istnieją różne zastosowania allofikocyjaniny; wiele instrumentów zostało opracowanych specjalnie dla allofikocyjaniny. Na przykład ten składnik jest powszechnie stosowany w testach immunologicznych, w tym FACS, cytometrii przepływowej itp.
Jakie są podobieństwa między fikocyjaniną a allofikocyjaniną?
- Fikocyjanina i allofikocyjanina to białka rozpuszczalne w wodzie
- Oba należą do rodziny fikobiliprotein.
Jaka jest różnica między fikocyjaniną a allofikocyjaniną?
Pykobiliproteiny to rodzina białek rozpuszczalnych w wodzie, które są obecne w sinicach i niektórych gatunkach alg. Fikocyjanina i allofikocyjanina to dwaj główni członkowie tej rodziny. Kluczowa różnica między fikocyjaniną a allofikocyjaniną polega na tym, że fikocyjanina pochłania i emituje przy krótszych długościach fal niż allofikocyjanina.
Poniższa infografika przedstawia więcej różnic między fikocyjaniną i allofikocyjaniną w formie tabelarycznej do bezpośredniego porównania.
Podsumowanie – fikocyjanina kontra allofikocyjanina
Pykobiliproteiny to rodzina białek rozpuszczalnych w wodzie, które są obecne w sinicach i niektórych gatunkach alg. Fikocyjanina i allofikocyjanina to dwaj główni członkowie tej rodziny. Kluczowa różnica między fikocyjaniną a allofikocyjaniną polega na tym, że fikocyjanina pochłania i emituje przy krótszych długościach fal niż allofikocyjanina.
