Kluczowa różnica między izoschizomerami a izokaudomerami polega na tym, że izoschizomery rozpoznają i rozszczepiają to samo miejsce restrykcyjne lub rozpoznawcze, podczas gdy izokaudomery rozpoznają nieco inne miejsca restrykcyjne i rozszczepiają w tym samym miejscu.
Enzymy restrykcyjne lub endonukleazy restrykcyjne to rodzaj nukleaz, które tną dwuniciowy DNA. Są w stanie rozpoznać określone sekwencje zwane miejscami restrykcyjnymi, które mają pochodzenie palindromiczne. Bakterie wytwarzają enzymy restrykcyjne przeciwko obcym patogenom, zwłaszcza przeciwko wirusom. Jest to forma mechanizmu obronnego wykazywanego przez bakterie. W zależności od struktury enzymu i charakteru nacięć, istnieją trzy typy enzymów restrykcyjnych, takie jak enzymy restrykcyjne typu I, enzymy restrykcyjne typu II i enzymy restrykcyjne typu II. Ponadto, w zależności od aktywności biochemicznej i źródła izolacji, istnieją trzy rodzaje enzymów restrykcyjnych, takie jak izoschizomery, neoschizomery i izokaudomery.
Czym są izoschizomery?
Izoschizomery to rodzaj enzymu restrykcyjnego, który pochodzi z różnych źródeł, ale rozpoznaje i rozszczepia to samo miejsce restrykcyjne w DNA. Dlatego dwa izoschizomery mają to samo miejsce rozpoznawania. Rozszczepiają się w tym samym miejscu, więc są specyficzne dla tej samej sekwencji rozpoznawania. Na przykład enzymy restrykcyjne SphI i BbuI to dwa izoschizomery, które rozpoznają i rozszczepiają CGTAC/G.
Rysunek 01: Enzym ograniczający
Kolejną parą izoschizomerów jest HpaII i MspI. Obaj rozpoznają sekwencję 5′-CCGG-3′ i przecinają DNA. Ponadto Bsp EI i Acc III są również izoschizomerami, które pochodzą odpowiednio z gatunku Bacillus i Acinetobacter calcoaceticus. Izolację izoschizomerów można przeprowadzić z różnych bakterii. Ponieważ pochodzą od różnych bakterii, ich warunki ograniczenia mogą się od siebie różnić.
Czym są izokaudomery?
Izokaudomery są rodzajem enzymu restrykcyjnego, który rozpoznaje nieco inne sekwencje, ale rozszczepiają w tym samym miejscu, tworząc te same końce. Izokaudomery również pochodzą od różnych bakterii. Sau3a i BamHI to para izokaudomerów. Wytwarzają lepki koniec 5’-GATC-3’ po rozszczepieniu tego samego miejsca. Inną parą izokaudomerów jest NcoI z Nocardia corallina i PagI z Pseudomonas alcaligenes. Te dwa enzymy również wiążą się w różnych rozpoznawanych sekwencjach, ale tną w tym samym miejscu i wytwarzają te same lepkie końce. Dzięki temu produkowane końcówki tnące są ze sobą kompatybilne i mogą być ze sobą ligowane. XhoI, PspXI i SalI są również izokaudomerami.
Jakie są podobieństwa między izoschizomerami a izokaudomerami?
- Izoschizomery i izokaudomery to dwa rodzaje enzymów restrykcyjnych.
- Dwa izoschizomery mają to samo miejsce trawienia, podobnie jak dwa izokaudomery, które mają to samo miejsce trawienia.
- Są pochodzenia prokariotycznego.
- Oba mają miejsce rozpoznawania ograniczeń oraz miejsce trawienia.
- Wytwarzają końcówki, które są ze sobą kompatybilne.
- Ponadto enzymy te są użytecznymi narzędziami w technologii rekombinacji DNA.
Jaka jest różnica między izoschizomerami a izokaudomerami?
Izoschizomery to enzymy restrykcyjne, które rozpoznają tę samą sekwencję DNA i rozszczepiają w tym samym miejscu restrykcyjnym, podczas gdy izokaudomery to enzymy restrykcyjne, które rozpoznają nieco inne sekwencje DNA, ale wytwarzają te same lepkie końce poprzez cięcie w tym samym miejscu. Tak więc jest to kluczowa różnica między izoschizomerami a izokaudoma.
Poniższa infografika przedstawia różnicę między izoschizomerami a izokaudomerami.
Podsumowanie – Izoschizomery kontra izokaudomery
Izoschizomery to enzymy restrykcyjne, które rozpoznają tę samą sekwencję DNA i rozszczepiają w tym samym miejscu. Z drugiej strony, izokaudomery są enzymami restrykcyjnymi, które rozpoznają nieco inne sekwencje i rozszczepiają w tym samym miejscu, wytwarzając te same końce. Jest to więc kluczowa różnica między izoschizomerami a izokaudomerami. SphI, BbuI, HpaII i MspI to kilka przykładów izoschizomerów, podczas gdy Sau3a i BamHI to dwa przykłady izokaudomerów. Zarówno izoschizomery, jak i izokaudomery są naturalnie wytwarzane przez bakterie.
