Kluczowa różnica między ekstrakcją DNA roślinnego i zwierzęcego polega na tym, że podczas ekstrakcji DNA roślinnego konieczne jest rozbicie ściany komórkowej poprzez zmielenie tkanki w suchym lodzie lub ciekłym azocie w celu uwolnienia zawartości komórkowej podczas ekstrakcji DNA zwierzęcego, nie jest konieczne wykonywanie tego kroku, ponieważ komórki zwierzęce nie mają ściany komórkowej.
Genomowy DNA to materiał genetyczny komórek roślinnych i zwierzęcych. Genomowy DNA jest unikalny dla każdej rośliny lub zwierzęcia. Ekstrakcja DNA dobrej jakości jest warunkiem wstępnym badań molekularnych. DNA organizmów jest ekstrahowane w celu identyfikacji, diagnozowania chorób, wykrywania określonych genów i sekwencji, celów kryminalistycznych, testowania ojcostwa, sekwencjonowania genomu i opracowywania leków itp. Metoda ekstrakcji DNA różni się w zależności od rodzaju komórek – czy jest to komórka zwierzęca czy komórka roślinna.
Co to jest ekstrakcja DNA roślin?
DNA w komórkach roślinnych jest ekstrahowane do różnych badań molekularnych. Wymagana jest ekstrakcja nienaruszonego, czystego genomowego DNA. W związku z tym istnieją różne typy protokołów ekstrakcji DNA, które różnią się od protokołów ekstrakcji DNA z komórek zwierzęcych. Dzieje się tak, ponieważ komórki roślinne mają ścianę komórkową, którą należy rozbić, aby usunąć zawartość komórkową.
Ekstrakcja jest zwykle wykonywana przez zmielenie tkanek roślinnych w suchym lodzie lub ciekłym azocie za pomocą moździerza i tłuczka. Następnie błony komórkowe są rozrywane, a zawartość komórek jest pobierana do buforu ekstrakcyjnego. Odbywa się to zwykle przy użyciu detergentu; Bufor SDS (dodecylosiarczan sodu) lub CTAB (bromek cetylotrimetyloamoniowy). Uwolniony DNA jest chroniony przed endogennymi nukleazami za pomocą czynnika chelatującego, takiego jak EDTA. Ponadto białka oddziela się od DNA za pomocą chloroformu lub fenolu.
Rysunek 01: Ekstrakcja DNA roślin
Rośliny syntetyzują polisacharydy i polifenole, w tym flawonoidy i inne metabolity wtórne. Związki te zakłócają ekstrakcję czystego genomowego DNA. Dlatego większość protokołów ekstrakcji DNA roślin obejmuje kolejny etap, taki jak technika gradientu gęstości chlorku cezu w celu wyeliminowania tych związków.
Większość protokołów ekstrakcji DNA zaleca używanie próbek świeżych liści do ekstrakcji DNA. Niektóre metody nie obejmują niebezpiecznych chemikaliów, takich jak ciekły azot i fenol. Protokół CTAB (cetyl trimethylammonium bromide) jest popularnym protokołem ekstrakcji DNA roślinnego, który ułatwia ekstrakcję wysokiej jakości genomowego DNA roślinnego. Jest to prosta, bezpieczna, niezawodna i opłacalna metoda ekstrakcji DNA roślinnego. Większość pozostałych metod to zmodyfikowane wersje metody CTAB.
Co to jest ekstrakcja zwierzęcego DNA?
Ekstrakcja zwierzęcego DNA to ekstrakcja genomowego DNA z komórek zwierzęcych do analizy molekularnej. W przeciwieństwie do ekstrakcji DNA roślinnego, rozpad ściany komórkowej nie jest konieczny dla komórek zwierzęcych, ponieważ nie mają one ściany komórkowej. Komórki krwi są najczęstszym rodzajem komórek zwierzęcych, które są wykorzystywane do różnych celów.
Rysunek 02: Ekstrakcja DNA
Metoda fenolowo-chloroformowa jest jedną z najlepszych metod dla komórek krwi. Wydajność i jakość DNA są wysokie podczas ekstrakcji DNA tą metodą. Jest to protokół ekstrakcji DNA ciecz-ciecz, a metoda ta rozdziela cząsteczki DNA na podstawie ich rozpuszczalności w niemieszających się roztworach. Fenol, chloroform i alkohol izoamylowy to trzy najlepsze składniki tej metody.
Jakie są podobieństwa między ekstrakcją DNA roślin i zwierząt?
- Podczas ekstrakcji DNA roślinnego i zwierzęcego, błony komórkowe muszą zostać przerwane.
- DNA powinno być chronione przed endogennymi nukleazami.
- Ponadto należy zapobiegać ścinaniu DNA.
- Dostępne są komercyjne zestawy do ekstrakcji DNA roślinnego i zwierzęcego.
- Większość metod ekstrakcji DNA roślinnego i zwierzęcego wymaga ciągłej modyfikacji i standaryzacji.
Jaka jest różnica między ekstrakcją DNA roślinnego a zwierzęcego?
Kluczowa różnica między ekstrakcją DNA roślinnego i zwierzęcego polega na tym, że ekstrakcja DNA roślinnego wymaga zmielenia tkanki roślinnej w suchym lodzie lub ciekłym azocie w celu rozbicia ściany komórkowej, podczas gdy ekstrakcja DNA zwierzęcego nie wymaga tego etapu, ponieważ komórki nie mają ściany komórkowej. Metoda CTAB jest jedną z najlepszych metod ekstrakcji DNA roślinnego, natomiast metoda fenolowo-chloroformowa jest jedną z najlepszych metod ekstrakcji DNA zwierzęcego.
Poniższa infografika przedstawia różnice między ekstrakcją DNA roślinnego i zwierzęcego.
Podsumowanie – Ekstrakcja DNA roślin vs zwierząt
Do ekstrakcji DNA z różnych typów komórek dostępne są różne metody. Dlatego protokoły ekstrakcji DNA roślinnego różnią się od protokołów ekstrakcji DNA komórek zwierzęcych. Ekstrakcja DNA roślinnego wymaga przerwania ściany komórkowej, błony komórkowej i błony jądrowej, podczas gdy ekstrakcja DNA zwierzęcego wymaga przerwania błony komórkowej i błony jądrowej. Co ważniejsze, ekstrakcja DNA z komórek zwierzęcych nie wymaga rozrywania ścian komórkowych przez zmielenie w suchym lodzie lub ciekłym azocie. Jest to zatem kluczowa różnica między ekstrakcją DNA roślinnego i zwierzęcego.
