Kluczowa różnica – promotorzy eukariotyczni a prokariotyczni
Transkrypcja to proces przekształcania informacji genetycznej przechowywanej w kodującej sekwencji DNA w sekwencję mRNA. Proces ten inicjuje specyficzny region DNA znajdujący się na końcu 5’ jednostki transkrypcyjnej. Region ten jest znany jako region promotora. Te promotory zazwyczaj znajdują się w sąsiedztwie miejsca startu transkrypcji. Długość promotora waha się od 100 pz do 1000 pz. Promotory różnią się w zależności od typu organizmu. Promotory eukariotyczne i prokariotyczne różnią się od siebie. U prokariontów znaleziono tylko trzy typy sekwencji promotorowych, mianowicie -10 promotorów, -35 promotorów i elementy poprzedzające. W organizmach eukariotycznych istnieje wiele różnych elementów promotorowych, takich jak kaseta TATA, elementy inicjatora, kaseta GC, kaseta CAAT itp. Jest to kluczowa różnica między promotorami eukariotycznymi i prokariotycznymi.
Czym są promotory eukariotyczne?
Trzy główne porcje; promotor główny, promotor proksymalny i promotor dystalny tworzą razem promotor. W kontekście eukariontów można znaleźć wiele elementów promotora, które są wysoce wyrafinowane i bardziej zróżnicowane niż promotory. Stwierdzono, że ze względu na złożoność promotorów eukariotycznych DNA ma zdolność do samozaginania się. Wyjaśnia to również fakt, że wpływ wielu sekwencji regulatorowych ma miejsce, mimo że są one oddalone o wiele kilozasad od miejsca transkrypcji. Te eukariotyczne promotory mają zdolność przenikania przez szeroki zakres sekwencji DNA.
Rysunek 01: Eukariotyczny promotor
Przykłady niektórych promotorów eukariotycznych to Pribnow box (TATA box), GC box, CAAT box itp. W kontekście TATA box jest to sekwencja 5' – TATAA -3' obecna w rdzeniu region promotora. Do kasety TATA przyłączone są białka czynnika transkrypcyjnego i białka histonowe. Wiązanie białek czynnika transkrypcyjnego do kasety TATA pomaga w wiązaniu polimerazy RNA, co z kolei prowadzi do powstania kompleksu transkrypcyjnego. Mówiąc prościej, wiązanie tych białek będzie napędzać proces transkrypcji. Proces ten zostanie zahamowany, gdy białka histonowe zwiążą się z blokiem TATA. Dlatego skrzynka TATA jest ważnym elementem promotora, który bierze udział w regulacji tempa transkrypcji eukariotycznej.
Czym są prokariotyczni promotorzy?
W organizmach prokariotycznych promotor zaangażowany w transkrypcję jest identyfikowany przez powiązany czynnik zwany czynnikiem sigma. Czynniki Sigma są unikalne dla różnych sekwencji promotorowych. Dlatego mówi się, że każdy pojedynczy czynnik sigma rozpoznałby pojedynczą sekwencję promotora rdzenia. Jest to unikalna cecha obecna w procesie transkrypcji prokariotycznej. Zarówno polimeraza RNA, jak i czynnik sigma wspólnie identyfikują prawidłowy region promotora i tworzą kompleks transkrypcyjny.
Promotor prokariotyczny zawiera tylko trzy rodzaje elementów promotora. Mniejsze zaangażowanie elementów promotorowych u prokariontów jest głównym powodem, dla którego ich proces transkrypcji jest mniej wyrafinowany w porównaniu z transkrypcją eukariotyczną, która obejmuje większą liczbę sekwencji promotorowych. Spośród trzech elementów promotorowych prokariotów istnieją dwie główne ważne dwie krótkie sekwencje DNA. Te sekwencje są klasyfikowane według ich lokalizacji. Są to promotory lub element -10 (obecny 10 pz powyżej miejsca startu transkrypcji), promotor lub element -35 (obecny 35 pz powyżej miejsca startu transkrypcji).
Rysunek 02: Prokariotyczny promotor
Promotor -10 jest odpowiednikiem eukariotycznej skrzynki TATA lub skrzynki Pribnowa i jest niezbędnym składnikiem do inicjacji transkrypcji u prokariotów. Promotor -35 składa się z sekwencji TTGACA, która aktywnie uczestniczy w regulacji tempa transkrypcji prokariotycznej.
Jakie są podobieństwa między promotorami eukariotycznymi i prokariotycznymi?
- W obu typach promotory są kontrolowane przez różne sekwencje regulatorowe DNA, które obejmują wzmacniacze, tłumiki, izolatory i elementy graniczne.
- Promotory to sekwencje, które inicjują transkrypcję u prokariontów i eukariontów.
- Promotorami są sekwencje DNA.
Jaka jest różnica między promotorami eukariotycznymi a prokariotycznymi?
Eukariotyczni kontra prokariotyczni promotorzy |
|
| Promotory eukariotyczne to sekwencje regulatorowe, które inicjują transkrypcję organizmów eukariotycznych. | Promotory prokariotyczne to sekwencje regulatorowe, które inicjują transkrypcję genów prokariotycznych. |
| Elementy | |
| Promotor prokariotyczny składa się z elementów upstream, -10 elementów i -35 elementów. | Promotor eukariotyczny składa się z pudełka Pribnowa (pudełko TATA), pudełka CAAT, pudełka GC i elementów inicjujących. |
Podsumowanie – promotorzy eukariotyczni kontra prokariotyczni
Promotor to region DNA, który obejmuje inicjację procesu zwanego transkrypcją. Te promotory znajdują się zazwyczaj przed miejscem startu transkrypcji. Trzy główne części, które tworzą promotor, to promotor główny, promotor proksymalny i promotor dystalny. W kontekście eukariontów istnieje wiele elementów promujących w regionie promotora, które są wysoce wyrafinowane i bardziej zróżnicowane niż prokariota. Przykładami niektórych eukariotycznych elementów promotora są Pribnow box (TATA box), GC box, CAAT box itp. W prokariotach są dwa główne ważne elementy promotora, mianowicie -10 element (który jest obecny 10 pz przed miejscem startu transkrypcji), -35 elementów (tj. obecne 35 pz powyżej miejsca startu transkrypcji). Promotor -10 inicjuje transkrypcję, a promotor -35 reguluje transkrypcję. Oba typy promotorów są kontrolowane przez różne sekwencje regulatorowe DNA, które obejmują wzmacniacze, tłumiki, izolatory i elementy graniczne. To jest różnica między promotorami eukariotycznymi i prokariotycznymi.
Pobierz PDF promotorów eukariotycznych kontra prokariotycznych
Możesz pobrać wersję PDF tego artykułu i używać jej do celów offline zgodnie z notatką cytowania. Proszę pobrać wersję PDF tutaj: Różnica między promotorem eukariotycznym a prokariotycznym
