Kluczowa różnica między tiocyjanianem guanidyny a chlorowodorkiem guanidyny polega na tym, że tiocyjanian guanidyny jest silniejszym środkiem denaturującym białko, który jest częściej stosowany w izolacji RNA, podczas gdy chlorowodorek guanidyny jest słabszym środkiem denaturującym białko, który jest rzadziej stosowany w izolacji RNA.
Denaturacja to proces, w którym białka tracą swoją strukturę czwartorzędową, trzeciorzędową i drugorzędową, która normalnie występuje w stanie natywnym. Można to zrobić przez zastosowanie pewnego stresu zewnętrznego lub związków, takich jak mocny kwas lub zasada, stężona sól nieorganiczna, rozpuszczalnik organiczny (alkohol, chloroform), mieszanie, promieniowanie lub ciepło. Tiocyjanian guanidyny i chlorowodorek guanidyny to dwa różne typy denaturantów białek.
Co to jest tiocyjanian guanidyny?
Tiocyjanian guanidyny (GTC) jest silniejszym środkiem denaturującym białko, częściej używanym do izolacji RNA. Jest również znany jako izotiocyjanian guanidyny (GITC). Będąc czynnikiem chaotropowym, jest związkiem chemicznym rutynowo stosowanym jako ogólny denaturant białek. Czynnik chaotropowy to cząsteczka w roztworze wodnym, która może zakłócić sieć wiązań wodorowych między cząsteczkami wody. Wpływa to na stabilność stanu natywnego innych cząsteczek w roztworze, takich jak makrocząsteczki, takie jak białka i kwasy nukleinowe, osłabiając efekt hydrofobowy. Czynniki chaotropowe, takie jak tiocyjanian guanidyny, zmniejszają stopień uporządkowania struktury białka tworzonego przez cząsteczki wody zarówno w otoczkach objętościowych, jak i hydratacyjnych wokół aminokwasów hydrofobowych. Może to spowodować denaturację białek.
Tiocyjanian guanidyny może być używany do dezaktywacji wirusów, takich jak grypa, które wywołują choroby, takie jak hiszpanka w 1918 roku. Dzięki temu może być stosowany w konfiguracjach medycznych lub szpitalnych. Co więcej, tiocyjanian guanidyny jest również stosowany do lizy komórek i cząsteczek wirusa w ekstrakcji RNA i DNA. Tutaj funkcją tiocyjanianu guanidyny jest wspomaganie działania lizy i zapobieganie aktywności enzymów RNaz i enzymów DNazy poprzez denaturację. W przeciwnym razie enzymy te uszkodzą ekstrakt (RNA lub DNA).
Co to jest chlorowodorek guanidyny?
Chlorowodorek guanidyny (GdnHCl) jest słabszym denaturantem białka, który jest rzadziej używany do izolacji RNA. Jest również znany jako chlorek guanidyny (GdmCl). Jest to chlorowodorek guanidyny. Chlorowodorek guanidyny jest chaotropowy i jest jednym z denaturantów stosowanych w fizykochemicznych badaniach fałdowania białek.
Rysunek 01: Chlorowodorek guanidyny
Chlorowodorek guanidyny ma również zdolność zmniejszania aktywności enzymów i zwiększania rozpuszczalności cząsteczek hydrofobowych. Normalnie przy wyższych stężeniach chlorowodorku guanidyny białka tracą swoją uporządkowaną strukturę. Przy tym stężeniu chlorowodorku guanidyny białka mają tendencję do losowego zwijania się. W placówkach medycznych lub szpitalnych chlorowodorek guanidyny jest wskazany w celu zmniejszenia objawów osłabienia mięśni i łatwej męczliwości związanej z zespołem Eatona-Lamberta. Ponadto skutki uboczne stosowania chlorowodorku guanidyny mogą obejmować peryst altykę, biegunkę i śmiertelne zahamowanie czynności szpiku kostnego.
Jakie są podobieństwa między tiocyjanianem guanidyny a chlorowodorkiem guanidyny?
- tiocyjanian guanidyny i chlorowodorek guanidyny to dwa różne typy denaturantów białek.
- Oba denaturanty mają w swoich strukturach guanidynę.
- Są agentami chaotropowymi.
- Oba denaturanty mogą być użyte do izolacji RNA.
- Oba są używane w placówkach medycznych lub szpitalnych.
Jaka jest różnica między tiocyjanianem guanidyny a chlorowodorkiem guanidyny?
tiocyjanian guanidyny jest silniejszym środkiem denaturującym białko, który jest częściej stosowany w izolacji RNA, podczas gdy chlorowodorek guanidyny jest słabszym środkiem denaturującym białko, który jest rzadziej stosowany w izolacji RNA. Jest to więc kluczowa różnica między tiocyjanianem guanidyny a chlorowodorkiem guanidyny. Ponadto wzór chemiczny tiocyjanianu guanidyny to C2H6N4S, podczas gdy wzór chemiczny chlorowodorku guanidyny to CH5N3HCl.
Poniższa infografika przedstawia różnice między tiocyjanianem guanidyny a chlorowodorkiem guanidyny w formie tabelarycznej dla porównania.
Podsumowanie – tiocyjanian guanidyny a chlorowodorek guanidyny
tiocyjanian guanidyny i chlorowodorek guanidyny to dwa różne typy denaturantów białek. Oba denaturanty są chaotropami. Tiocyjanian guanidyny jest silniejszym środkiem denaturującym białko, częściej stosowanym do izolacji RNA, podczas gdy chlorowodorek guanidyny jest słabszym środkiem denaturującym białko, rzadziej stosowanym do izolacji RNA. To podsumowuje różnicę między tiocyjanianem guanidyny a chlorowodorkiem guanidyny.
