Kluczowa różnica między TATA a CAAT box polega na tym, że TATA box jest konserwatywnym regionem nukleotydowym o sekwencji konsensusowej TATAWAW, podczas gdy CAAT box jest konserwatywnym regionem nukleotydowym o sekwencji zgodnej GGCCAATCT.
TATA box i CAAT box to dwa regiony nukleotydów, które wpływają na transkrypcję genów eukariotycznych. Są to niekodujące sekwencje DNA znajdujące się przed miejscem inicjacji transkrypcji. W rzeczywistości znajdują się w regionie regulatorowym, znanym jako promotor. Za wydajność transkrypcji odpowiadają zarówno TATA box, jak i CAAT box. Są to sekwencje konsensusowe, które nie zmieniły się w trakcie procesu ewolucyjnego.
Co to jest TATA Box?
TATA box lub Goldberg-Hogness box to sekwencja konsensusowa znaleziona w regionie promotorowym genów eukariotycznych. Kluczowym elementem promotora jest TATA box. Znajduje się 25 par zasad powyżej miejsca inicjacji transkrypcji. Jest zachowany podczas całego procesu ewolucyjnego. Sekwencja konsensusowa bloku TATA to TATAWAW, gdzie W oznacza A lub T. Jest to niekodująca sekwencja DNA. Jednak kaseta TATA jest ważna dla transkrypcji genu. Jest miejscem wiązania białka wiążącego TATA (TBP) i innych czynników transkrypcyjnych. Po związaniu się z blokiem TATA, rekrutacja polimerazy RNA II i właściwa regulacja transkrypcji ma miejsce w genach eukariotycznych.
Rysunek 01: Pudełko TATA
Ponieważ TATA box bierze udział w regulacji transkrypcji, mutacje TATA box mogą skutkować zmianami fenotypowymi prowadzącymi do chorób takich jak rak żołądka, ataksja rdzeniowo-móżdżkowa, choroba Huntingtona, ślepota, β-talasemia, immunosupresja, zespół Gilberta, i HIV-1 itp.
Co to jest skrzynka CAAT?
CAAT box to region nukleotydów o sekwencji konsensusowej GGCCAATCT. Podobnie jak TATA box, CAAT box znajduje się również w regionie promotorowym genu. Dlatego znajduje się około 75-80 par zasad w górę od miejsca transkrypcji.
Rysunek 02: Skrzynka CAAT
Swoiste czynniki transkrypcyjne wiążą się ze skrzynką CAAT. To wiązanie stabilizuje kompleks preinicjacji, ułatwiając wiązanie enzymu polimerazy RNA. Podobnie skrzynka CAAT działa jako sekwencja regulacyjna. Mutacje w regionie kasety CAAT silnie wpływają na odpowiedź promotora i regulację transkrypcji.
Jakie są podobieństwa między TATA a CAAT Box?
- TATA i CAAT to dwa regiony nukleotydów znajdujące się w sekwencji regulatorowej genów eukariotycznych.
- Znajdują się one przed miejscem inicjacji transkrypcji.
- Obie są zgodne sekwencjami DNA.
- Są one niezbędne do regulacji transkrypcji, więc są sekwencjami regulatorowymi.
Jaka jest różnica między TATA a CAAT Box?
TATA box to konserwowany region nukleotydowy znaleziony około 25-30 par zasad w górę od miejsca inicjacji transkrypcji. Z drugiej strony kaseta CAAT jest konserwatywnym regionem nukleotydów znalezionym około 75-80 par zasad w górę od miejsca inicjacji transkrypcji. To jest kluczowa różnica między skrzynką TATA i CAAT. Poza tym TATA box ma sekwencję konsensusową TATAWAW, podczas gdy GGCCAATCT jest sekwencją konsensusową CAAT box.
Ponadto, kolejną istotną różnicą między kasetą TATA i CAAT jest to, że kaseta TATA zapewnia miejsce wiązania dla TBP i czynników transkrypcyjnych oraz uczestniczy w regulacji transkrypcji, podczas gdy kaseta CAAT sygnalizuje miejsce wiązania dla czynnika transkrypcyjnego RNA.
Poniższa infografika podsumowuje różnice między skrzynkami TATA i CAAT.
Podsumowanie – TATA vs CAAT Box
TATA box i CAAT box to dwie części konserwatywnego regionu promotorów genów eukariotycznych. Znajdują się one powyżej miejsca inicjacji transkrypcji. Oba wpływają na transkrypcję genów, zapewniając miejsca wiązania białek wiążących TATA i czynniki inicjacji transkrypcji. Kaseta TATA znajduje się 25-35 par zasad w górę od miejsca inicjacji transkrypcji, podczas gdy kaseta CAAT znajduje się 75-80 par zasad w górę od miejsca inicjacji transkrypcji. Sekwencja konsensusowa kasety TATA to TATAWAW, podczas gdy sekwencja konsensusowa kasety CAAT to GGCCAATCT. Tak więc jest to podsumowanie różnicy między skrzynkami TATA i CAAT.
