Kluczowa różnica między złożonymi transpozonami a elementami IS polega na tym, że złożone transpozony są rodzajem transpozonów, które przenoszą geny pomocnicze, takie jak geny oporności na antybiotyki, podczas gdy elementy IS (lub elementy sekwencji insercyjnej) są elementami transpozycyjnymi, które przenoszą tylko geny, które transpozaza kodu, która katalizuje aktywność transpozycji.
Transpozon to fragment DNA, który może zmienić swoją pozycję w genomie bakterii. Dlatego są to mobilne sekwencje DNA. Przemieszczają się w nowe miejsca genomu, dokonując zmian w sekwencji genomu bakteryjnego, powodując istotne zmiany informacji genetycznej. Transpozony są również znane jako geny przeskakujące, ponieważ mogą blokować transkrypcję genów i zmieniać układ materiału genetycznego bakterii. Ponadto odpowiadają za przemieszczanie się genów lekooporności, antybiotykooporności między plazmidami a chromosomami. Transpozony kompozytowe i elementy IS to dwa rodzaje ruchomych elementów genetycznych występujących w bakteriach. Oba mogą przemieszczać się z jednego miejsca do drugiego w genomie.
Co to są transpozony złożone?
Złożony transpozon to segment DNA oflankowany przez dwie kopie podobnych elementów sekwencji insercyjnej. W złożonym transpozonie znajduje się centralny region kodujący białko. Geny są często genami opornymi na antybiotyki. Mogą również zawierać geny kataboliczne. Ponadto transpozon złożony składa się z dwóch odwróconych powtórzeń. Cała długość kompozytowego transpozonu porusza się jako jedna kompletna jednostka.
Rysunek 01: Transpozon kompozytowy
Tn10 to złożony transpozon. Składa się z centralnego regionu kodującego o długości 6,5 kb (gen oporny na tetracyklinę) i elementów odwróconej sekwencji insercji o długości 1,4 kb na każdym końcu. Elementy IS dostarczają transpozazę. Transpozaza to enzym, który katalizuje ruch transpozonu. Transpozony kompozytowe można amplifikować, projektując startery dla elementów IS.
Czym są elementy IS?
Elementy sekwencji wstawiania lub elementy IS są rodzajem ruchomego elementu genetycznego. Są prostą formą transpozonów. Przenoszą tylko geny kodujące enzymy transpozazy. Enzymy transpozazy katalizują transpozycję transpozonów. Strukturalnie sekwencja kodująca elementów IS jest otoczona dwoma odwróconymi powtórzeniami. Na przykład element IS o nazwie IS911 jest oflankowany przez dwa końce z odwróconymi powtórzeniami o długości 36 pz.
Is to najliczniejsze autonomiczne elementy transpozycyjne w genomie bakteryjnym. Dlatego są niezwykle ważne dla organizacji i ewolucji genomu prokariotycznego. Ponadto elementy IS występują jako części transpozonów kompozytowych. Ogólnie rzecz biorąc, dwa elementy IS znajdują się po bokach sekwencji kodującej złożonego transpozonu. Jednak transpozony jednostek nie zawierają flankujących elementów IS.
Ponieważ elementy IS mogą poruszać się w genomie, mogą przerywać sekwencję kodującą innych genów i dezaktywować geny poprzez blokowanie ekspresji.
Jakie są podobieństwa między transpozonami kompozytowymi a elementami IS?
- Zarówno transpozony kompozytowe, jak i elementy IS są w stanie zmienić pozycję w genomie bakterii.
- Region kodujący w obu transpozonach jest zwykle oflankowany przez odwrócone powtórzenia.
- Złożony transpozon jest otoczony przez dwa oddzielne elementy IS.
Jaka jest różnica między transpozonami kompozytowymi a elementami IS?
Transpozony kompozytowe to ruchome elementy genetyczne składające się z dwóch sekwencji insercyjnych (IS) często flankujących jeden lub więcej genów oporności na antybiotyki. Z drugiej strony elementy IS są rodzajem prostego elementu transpozycyjnego, który zawiera geny kodujące enzym transpozazę katalizujący transpozycję. To jest więc kluczowa różnica między złożonymi transpozonami a elementami IS.
Poniżej znajduje się lista różnic między złożonymi transpozonami a elementami IS w formie tabelarycznej do porównania.
Podsumowanie – Transpozony kompozytowe a elementy IS
Genom bakteryjny zawiera ruchome elementy genetyczne. Transpozony kompozytowe i elementy IS to dwa rodzaje ruchomych elementów genetycznych. Transpozony kompozytowe niosą geny oporności na antybiotyki i flankujące elementy IS. Elementy IS niosą kod genetyczny do produkcji transpozazy, która katalizuje ruch transpozonów. Jest to więc kluczowa różnica między złożonymi transpozonami a elementami IS.
