Kluczowa różnica między Cosmidem a Phagemidem polega na rodzaju zawartych w nim sekwencji. Kosmid zawiera miejsce cos i plazmid. Dlatego jest to wektor hybrydowy, podczas gdy Phagemid jest plazmidem zawierającym początek replikacji F1 faga F1.
Kosmidy i fagemidy są używane do klonowania, zwłaszcza do klonowania większych fragmentów DNA. Są one szeroko stosowane zwłaszcza w klonowaniu genów odpowiedzialnych za produkcję różnych białek. Kosmidy i fagmidy są albo replikowane same jako plazmidy, albo są pakowane w cząstki wirusowe, a następnie replikowane.
Czym jest kosmid?
A Kosmid, określany jako plazmid hybrydowy, zawiera miejsca cos wyekstrahowane z cząstek faga Lambda i plazmidu. Te miejsca cos są długimi fragmentami DNA z 200 parami zasad. W związku z tym mają spoiste lub lepkie końce, które pozwalają plazmidowi dopasować się do wirusowego DNA. W związku z tym miejsca cos są niezbędne do pakowania DNA.
Istnieją trzy strony cos;
- miejsce cosN – zaangażowane w przecinanie nici DNA przez aktywność terminazy
- cosB site – zajmuje się utrzymywaniem terminazy.
- cosQ site – zaangażowane w zapobieganie degradacji DNA przez DNazy.
Rysunek 01: Kosmid
Ponadto kosmidy mogą replikować jednoniciowy DNA lub dwuniciowy DNA przy użyciu odpowiedniego miejsca startu replikacji. Kosmidy zwykle zawierają geny oporności na antybiotyki jako markery do selekcji transformantów. Zatem użycie kosmidu jako wektora może ułatwić klonowanie, a trawienie enzymami restrykcyjnymi wektora może następnie wyekstrahować te fragmenty.
Co to jest Phagemid (Phasmid)?
Fagemid, określany również jako Phasmid, jest również rodzajem wektora hybrydowego. Phagemid zawiera specjalny początek replikacji, określany jako początek replikacji f1. Początek f1 replikacji ekstraktów z faga f1.
Fagemid może replikować zarówno jednoniciowy, jak i dwuniciowy DNA. Replikacja może mieć miejsce albo jako plazmid podczas niezależnej replikacji, albo może zostać upakowana w cząstki faga i ostatecznie zainfekować bakteryjnego gospodarza E coli. Podczas infekowania komórek E coli fag f1 wymaga obecności pilusa. Dlatego pilusy płciowe są ważne podczas pakowania Phagemidów in vitro.
Jakie są podobieństwa między kosmidem a fagemidem?
- Zarówno Kosmid, jak i Fagemid są wektorami do klonowania używanymi w technologii rekombinacji DNA.
- Kosmidy i fagemidy mogą replikować jednoniciowe i dwuniciowe DNA.
- Oba mogą podlegać niezależnej replikacji, podobnie jak plazmidy.
- Kosmidy i fagemidy mogą być poddawane pakowaniu in vitro i infekować komórki bakteryjne.
- Zarówno kosmid, jak i fagemid wymagają odpowiedniego początku replikacji do klonowania.
Jaka jest różnica między kosmidem a fagemidem?
Kosmid kontra Phagemid |
|
| Cosmid to wektor hybrydowy, który zawiera miejsce cos i plazmid. | Fagemid to plazmid, który zawiera początek replikacji F1 faga F1. |
| Obecność witryn Cos | |
| Miejsca Cos są obecne w kosmidzie i są niezbędne do pakowania in vitro. | Strony Cos są nieobecne w fagemidzie. |
| Obecność źródła replikacji F1 | |
| W kosmidzie fi początek replikacji może być obecny lub nie. | Początek replikacji F1 jest obecny w fagemidzie. |
| Obecność genów odpornych na antybiotyki | |
| Geny oporności na antybiotyki są obecne w kosmidach w celu identyfikacji transformantów od nietransformantów. | Fagemidy nie zawierają genów oporności na antybiotyki. |
| Wymaganie pakowania in vitro | |
| Wymaga witryny cos. | Wymaga pilusa seksualnego. |
Podsumowanie – Kosmid kontra Phagemid
Cosmid i Phagemid to wektory do klonowania stosowane w technologii rekombinacji DNA. Kosmidy to wektory hybrydowe, które zawierają specjalne lepkie końce znane jako miejsca cos. Opakowania in vitro wymagają tych cos witryn. Podczas gdy fagemidy są plazmidami, które zawierają początek replikacji f1 wyekstrahowany z faga f1. Zarówno kosmid, jak i fagemid mogą podlegać niezależnej replikacji lub pakowaniu in vitro do komórek bakteryjnych. To są ważne różnice między kosmidem a fagemidem.
