Kluczowa różnica między testem LAMP i PCR polega na tym, że LAMP jest przeprowadzana w stałej temperaturze (60-650C) w celu wytworzenia kopii DNA poprzez amplifikację, podczas gdy przeprowadzana jest reakcja PCR użycie serii zmian temperatury w celu wytworzenia kopii DNA poprzez amplifikację.
LAMP i PCR to techniki amplifikacji in-vitro używane do wytwarzania tysięcy kopii DNA. Ilość DNA wytworzonego w LAMP jest znacznie wyższa niż ilość wytworzona w technikach PCR, takich jak RT-PCR. LAMP to nowsza technika w porównaniu z techniką PCR. Ale dla wyszkolonego naukowca jest to technicznie proste i łatwe do wykonania w warunkach laboratoryjnych. To sprawia, że jest to potencjalnie użyteczna technika wykrywania COVID-19. Jednak RT-PCR jest obecnie standardowym testem na COVID-19. Techniki te, choć dobrze znane badaczom i klinicystom z doświadczeniem w zakresie amplifikacji DNA, wciąż mogą być stosunkowo nieznane szerszej społeczności.
Co to jest test LAMP?
Izotermiczna amplifikacja za pośrednictwem pętli (LAMP) do testów na COVID-19 zaczyna się od pobrania próbek z nosa lub gardła za pomocą wacika. Próbki można również pobierać innymi metodami, np. śluzem z kaszlu. Podobnie jak technika PCR, taka jak RT-PCR, wirusowy RNA w próbce jest najpierw przekształcany w DNA, co umożliwia jego kopiowanie. Reakcja LAMP jest prowadzona w stałej temperaturze (60-650C).
Amplifikację wirusowego DNA z wykorzystaniem technologii i odczynników LAMP można wykryć, gdy mieszanina reakcyjna staje się mętna z powodu wytwarzania „pirofosforanu magnezu”. To zmętnienie umożliwia łatwą diagnozę COVID-19 przez naukowców i klinicystów. Dokładność wyników testu można poprawić, stosując w mieszaninie reakcyjnej specjalne barwniki fluorescencyjne lub barwniki zmieniające kolor. Barwniki te oddziałują z wirusowym DNA, a intensywność zmiany światła lub koloru może być mierzona, aby określić liczbę cząsteczek wirusowego RNA w przybliżeniu, która była początkowo w próbce.
Co to jest test PCR?
PCR to bardzo powszechna technika naukowa, która jest szeroko stosowana w badaniach i medycynie od 20-30 lat do wykrywania DNA. Testy PCR są używane bezpośrednio do wykrywania antygenu poprzez wykrywanie wirusowego RNA. Ogólnie rzecz biorąc, wirusowe RNA jest obecne w organizmie przed wykryciem przeciwciał lub wystąpieniem objawów choroby. Dlatego test PCR może stwierdzić, czy ktoś wcześnie ma wirusa. Obecnie standardowym testem do wykrywania COVID-19 jest PCR. Istnieją różne rodzaje technik PCR, takie jak real-time PCR, nested PCR, multiplex PCR, hot start PCR i long-range PCR itp. PCR wykorzystuje serię zmian temperatury w celu wytworzenia kopii DNA poprzez amplifikację.
RT-PCR to specjalna wersja techniki PCR. Jest używany, gdy wykrywany jest RNA. Jest teraz używany do testowania COVID-19. RT-PCR to dość czuła i niezawodna technika. W RT-PCR, po pobraniu próbki, chemikalia są używane do usuwania niechcianych białek, tłuszczów i innych cząsteczek, pozostawiając za sobą RNA. Enzymy z zestawu testowego najpierw przekształcają RNA w DNA, które następnie wzmacnia wirusowe DNA w celu wykrycia wirusa. Barwniki fluorescencyjne są zwykle stosowane do wiązania się z amplifikowanym DNA i wytwarzania światła. Może to zostać odczytane przez maszynę w celu uzyskania wyniku testu.
Jakie są podobieństwa między testem LAMP i PCR?
- Są to techniki wzmacniające.
- Oba produkują skopiowane DNA.
- Są to bardzo czułe i niezawodne techniki niż techniki immunologiczne, takie jak wykrywanie przeciwciał.
- Oba są używane do testowania COVID-19.
Jaka jest różnica między testem LAMP a PCR?
Kluczowa różnica między testami LAMP i PCR polega na tym, że w LAMP amplifikacja jest osiągana przy użyciu stałej temperatury (60-650C), podczas gdy w PCR, cykl temperatura jest wymagana. Obecnie dostępnych jest kilka rodzajów technik LAMP. Jednak najważniejszymi metodami wykrywania COVID-19 są technika izotermiczna za pośrednictwem pętli odwrotnej transkrypcji (RT-LAMP) i amplifikacja za pośrednictwem transkrypcji (TMA). Ponadto w praktyce klinicznej dostępne są obecnie różne rodzaje technik PCR do diagnozowania chorób, takie jak real-time PCR, RT-PCR, nested PCR, multiplex PCR, hot-start PCR, long-range PCR itp.
Poniższa infografika przedstawia różnice między testami LAMP i PCR w formie tabelarycznej.
Podsumowanie – Test LAMP vs PCR
Izotermiczna amplifikacja za pośrednictwem pętli jest procesem podobnym do testów PCR, takich jak RT-PCR, ale wytwarza więcej kopii wirusowego DNA w stałej temperaturze. Test reakcji łańcuchowej polimerazy jest obecnie najbardziej powszechną i standardową formą testowania na świecie do diagnozowania chorób, takich jak diagnoza COVID-19. Jest postrzegany jako dość niezawodny. PCR wykorzystuje serię zmian temperatury w celu wytworzenia kopii DNA poprzez amplifikację. W ten sposób podsumowuje różnicę między testem LAMP i PCR.
