Kluczowa różnica między dATP i ddATP polega na tym, że dATP nie przerywa syntezy DNA, podczas gdy ddATP może przerwać syntezę DNA. Dzieje się tak, ponieważ ddATP ma atom H przyłączony do pozycji 3ʹ cukru pentozowego, podczas gdy dATP ma grupę OH przyłączoną do pozycji 3ʹ.
dNTP to cegiełki DNA. Istnieją cztery typy dNTPs w zależności od zasad purynowych lub pirymidynowych – jedna z nich to dATP. Azotową zasadą dATP jest adenozyna. ddNTP to nukleotydy używane w sekwencjonowaniu metodą Sangera. Istnieją cztery typy ddNTP. ddATP to ddNTPs.
Co to jest dATP?
Trójfosforan dezoksyadenozyny to nukleotyd, który jest elementem budulcowym DNA. Enzym polimerazy DNA wykorzystuje dATP jako substrat do syntezy DNA. dATP składa się z trzech składników: cząsteczki cukru dezoksyrybozy, adenozyny i trzech grup fosforanowych. Dlatego jest trifosforanem nukleozydu purynowego. Wzór chemiczny dATP to C10H16N5O12 P3, , a jego masa cząsteczkowa wynosi 491.182.
Rysunek 01: dATP
dATP różni się od ATP (trójfosforanu adenozyny) pod względem składników cukrowych. ATP zawiera cukier rybozy. Pary zasad dATP z nukleotydem uracylowym podczas transkrypcji. Oprócz uczestniczenia w syntezie DNA, dATP może działać jako cząsteczka przenosząca energię w celu utrzymania żywotności komórek. Wysoki poziom dATP w organizmie jest toksyczny, ponieważ może działać jako niekonkurencyjny inhibitor enzymu reduktazy rybonukleotydowej. Może prowadzić do upośledzenia funkcji układu odpornościowego.
Co to jest ddATP?
Trójfosfat dideoksyadenozyny lub ddATP to jeden z czterech typów nukleotydów stosowanych w metodzie sekwencjonowania Sangera. Strukturalnie ddATP ma również trzy elementy podobne do dATP. Są bazą adeninową, cukrem dezoksyrybozowym i trzema fosforanami.
Rysunek 02: ddATP
W przeciwieństwie do dATP, ddATP nie ma grupy OH w pozycji 3ʹ cukru pentozowego, aby utworzyć wiązanie fosfodiestrowe z sąsiednim nukleotydem i kontynuować wydłużanie łańcucha. Posiada atom H w pozycji 3ʹ. Dlatego po włączeniu ddATP synteza DNA dobiega końca. Jest to podstawowa zasada sekwencjonowania Sangera. Dlatego ddATP działa jako inhibitor wydłużania łańcucha w sekwencjonowaniu Sangera. W sekwencjonowaniu Sangera używa się czterech probówek, a ddATP dodaje się do jednej probówki.
Jakie są podobieństwa między dATP i ddATP?
- dATP i ddATP to nukleotydy.
- Oba składają się z adeniny, dezoksyrybozy i trzech fosforanów.
- Są to związki organiczne.
- Zarówno dATP, jak i ddATP są dodawane do probówek w sekwencjonowaniu Sangera.
Jaka jest różnica między dATP a ddATP?
dATP ma grupę OH w pozycji 3ʹ cukru pentozowego, podczas gdy ddATP nie ma grupy OH w pozycji 3ʹ cukru pentozowego. Ponadto dATP jest monomerem stosowanym w syntezie DNA, podczas gdy ddATP jest używany do zakończenia wydłużania łańcucha podczas sekwencjonowania Sangera. To jest więc kluczowa różnica między dATP i ddATP. Co więcej, dATP może tworzyć wiązania fosfodiestrowe, podczas gdy ddATP nie może tworzyć wiązań fosfodiestrowych.
Poniższa infografika pokazuje więcej różnic między dATP i ddATP w formie tabelarycznej do bezpośredniego porównania.
Podsumowanie – dATP kontra ddATP
W skrócie, dATP jest prekursorem syntezy DNA, podczas gdy ddATP jest nukleotydem używanym do zakończenia syntezy DNA w sekwencjonowaniu Sangera. Ponadto dATP posiada grupę OH w pozycji 3' cukru pentozowego i umożliwia tworzenie wiązania fosfodiestrowego z kolejnym nukleotydem. Tymczasem w ddATP brakuje grupy OH w pozycji 3ʹ; stąd nie jest w stanie utworzyć wiązania fosfodiestrowego z następnym nukleotydem. W efekcie sekwencja DNA przestaje się wydłużać. W ten sposób podsumowuje różnicę między dATP i ddATP.
