Kluczowa różnica między terminacją zależną od Rho a terminacją niezależną od Rho polega na tym, że w terminacji zależnej od Rho czynnik Rho wiąże się z transkrypcją i przerywa transkrypcję poprzez zerwanie wiązań wodorowych między matrycą a transkryptem, podczas gdy terminacja niezależna od Rho kończy transkrypcję przez wytworzenie struktury pętli spinki do włosów, a następnie regionu bogatego w U w transkrypcie.
Transkrypcja to jeden z dwóch etapów ekspresji genów. Jest to proces, który wytwarza sekwencję mRNA z informacji genetycznej ukrytej w sekwencji DNA genu. Transkrypcja odbywa się w trzech etapach: inicjacja, elongacja i zakończenie. Enzym polimeraza RNA wiąże się z sekwencją promotora genu i zaczyna katalizować syntezę nici RNA. Dopóki nie zostanie znaleziona sekwencja terminatora, polimeraza RNA dodaje nukleotydy i buduje nić RNA. U prokariontów terminacja odbywa się za pomocą dwóch głównych strategii terminacji: terminacji zależnej od Rho i terminacji niezależnej od Rho. Czynnik Rho to białko o aktywności helikazy.
Co to jest wypowiedzenie zależne od Rho?
Zależna od Rho terminacja jest jednym z dwóch rodzajów strategii terminacji transkrypcji występujących u prokariontów. Czynnik Rho to białko o aktywności helikazy.
Rysunek 01: Zakończenie zależne od Rho
Białko Rho wiąże się z transkryptem RNA i porusza się wzdłuż polimerazy RNA w kierunku 5’-3’, zachęcając do dysocjacji wiązań wodorowych między matrycą DNA a transkryptem RNA. Kiedy czynnik Rho dotrze do bańki transkrypcyjnej, rozrywa hybrydę DNA/RNA i uwalnia transkrypt z bańki transkrypcyjnej. Gdy to nastąpi, kończy transkrypcję.
Co to jest niezależne rozwiązanie Rho?
Niezależna terminacja Rho jest drugą strategią, która kończy transkrypcję prokariotyczną. Zazwyczaj region terminatora ma odwróconą sekwencję powtórzeń. Bezpośrednio po sekwencji odwróconego powtórzenia znajduje się region bogaty w adeninę (AAAA). Kiedy polimeraza RNA porusza się do przodu, wytwarza sekwencję mRNA. Ponieważ dwa regiony są komplementarne w regionie odwróconej sekwencji powtórzeń, tworzy strukturę pętli spinki do włosów z powodu wiązania wodorowego. Następnym regionem będzie region bogaty w U. Struktura spinki do włosów zatrzymuje aktywność polimerazy RNA.
Rysunek 02: Niezależne zakończenie Rho
Co więcej, w regionach bogatych w U występują słabe interakcje między zasadami U transkryptu i zasadami A szablonu. Te słabe wiązania adenina-uracyl destabilizują matrycę DNA i transkrypt RNA i oddzielają się od siebie. W końcu transkrypcja uwalnia się z miejsca transkrypcji.
Jakie są podobieństwa między zależnym od Rho a niezależnym zakończeniem Rho?
- Zależne od Rho i niezależne od Rho zakończenie to dwie główne strategie zakończenia występujące u prokariotów.
- Obie formy uwalniają transkrypcję z szablonu DNA w celu zakończenia transkrypcji.
Jaka jest różnica między zależnym od Rho a niezależnym zakończeniem Rho?
W terminacji zależnej od Rho pośredniczy białko Rho, podczas gdy terminacja niezależna od Rho zachodzi poprzez tworzenie struktury pętli spinki do włosów. Jest to więc kluczowa różnica między zakończeniem zależnym od Rho i niezależnym od Rho. Ponadto białko Rho wykorzystuje energię ATP, podczas gdy niezależna terminacja Rho nie obejmuje białka Rho i nie wykorzystuje energii ATP. Dlatego jest to również znacząca różnica między zakończeniem zależnym od Rho i niezależnym od Rho.
Poniższa infografika pokazuje więcej porównań związanych z różnicą między zakończeniem zależnym i niezależnym od Rho.
Podsumowanie – Zależne od Rho kontra niezależne zakończenie Rho
Zależna od Rho i niezależna od Rho terminacja to dwa główne mechanizmy terminacji transkrypcji występujące u prokariontów. Białko Rho jest odpowiedzialne za terminację transkrypcji w terminacji zależnej od Rho. W przeciwieństwie do tego, niezależne zakończenie Rho następuje poprzez tworzenie struktury pętli spinki do włosów. Jest to więc kluczowa różnica między zakończeniem zależnym od Rho i niezależnym od Rho.
