Kluczowa różnica między miejscem aktywnym a miejscem wiązania polega na tym, że miejsce aktywne wspomaga katalizę reakcji chemicznej, podczas gdy miejsce wiązania pomaga w wiązaniu liganda z dużą cząsteczką.
Miejsce wiązania to region na białku, DNA lub RNA, z którym może się związać ligand. Enzymy to białka. Miejsce aktywne to region na enzymie, z którym substraty mogą się związać, aby przejść reakcję chemiczną. Ten specyficzny region ma również miejsce wiązania wraz z miejscem katalitycznym. Dlatego miejsca wiążące pomagają tylko w wiązaniu liganda z dużą cząsteczką, podczas gdy miejsca aktywne pomagają zarówno w wiązaniu liganda z dużą cząsteczką, jednocześnie pozwalając mu przejść katalizowaną reakcję chemiczną.
Co to jest aktywna witryna?
Miejsce aktywne to obszar na enzymie, z którym wiążą się substraty reakcji chemicznej, aby przejść katalizowaną reakcję chemiczną. region ten składa się z dwóch podregionów jako miejsca wiązania i miejsca katalitycznego. Miejsce wiązania zawiera pewne reszty, które mogą pomóc w wiązaniu substratu (reagentów) do enzymu. Miejsce katalityczne pomaga w katalizacji reakcji chemicznej. Co więcej, region ten jest bardzo mały w porównaniu z całą objętością enzymu; około 10-20% całej objętości enzymu.
Rysunek 01: Miejsce wiązania i miejsce katalityczne aktywnego miejsca
Zwykle miejsce aktywne zawiera 3-4 aminokwasy. pozostałe aminokwasy w enzymie biorą udział w utrzymaniu trzeciorzędowej struktury enzymu. Co ważniejsze, miejsce aktywne ma specyficzną konstrukcję, która pasuje do konkretnego podłoża. Dlatego enzymy te reagują tylko z określonymi substratami. Ale czasami enzymy potrzebują kofaktorów do swojej funkcji. Główną funkcją miejsca aktywnego jest zmniejszenie energii aktywacji reakcji chemicznej, a tym samym zwiększenie szybkości reakcji.
Co to jest Binding Site?
Miejsce wiązania to region na białku, DNA lub RNA, z którym mogą się wiązać ligandy. Tam ligand może utworzyć wiązanie chemiczne z tym miejscem. Regiony te wykazują specyfikę; konkretny ligand zwiąże się z konkretnym miejscem wiązania. Dlatego to miejsce jest miarą rodzajów ligandów, które mogą wiązać się z cząsteczką.
Co więcej, często używamy tych regionów do funkcjonalnej charakterystyki biomolekuł. Na przykład możemy scharakteryzować funkcjonalność strony aktywnej poprzez jej stronę wiązania. Ponadto, w przypadku DNA, specyficznym typem miejsca wiązania jest miejsce wiązania czynnika transkrypcyjnego obecne na DNA.
Jaka jest różnica między witryną aktywną a witryną powiązaną?
Miejsce aktywne to region na enzymie, z którym wiążą się substraty reakcji chemicznej, aby przejść katalizowaną reakcję chemiczną, podczas gdy miejsce wiązania to region na białku, DNA lub RNA, z którym mogą się wiązać ligandy. Jest to kluczowa różnica między miejscem aktywnym a miejscem wiązania. Co więcej, miejsca aktywne są obecne na enzymach i pomagają zwiększyć szybkość określonej reakcji chemicznej poprzez zmniejszenie bariery energii aktywacji tej reakcji. Z drugiej strony miejsca wiążące są odpowiedzialne za wiązanie specyficznego liganda z konkretną cząsteczką.
Poniższa infografika przedstawia różnicę między miejscem aktywnym a miejscem wiążącym w formie tabelarycznej.
Podsumowanie – Witryna aktywna a witryna powiązana
Miejsca aktywne to regiony na enzymach, które mogą zwiększyć szybkość reakcji chemicznej poprzez zmniejszenie bariery energii aktywacji tej reakcji. Miejscem wiązania jest dowolny region, z którym może się związać ligand. Aktywna witryna zawiera również witrynę powiązania. Różnica między miejscem aktywnym a miejscami wiążącymi polega na istnieniu i funkcjonalności. Dlatego kluczowa różnica między miejscem aktywnym a miejscem wiązania polega na tym, że miejsce aktywne pomaga w katalizie reakcji chemicznej, podczas gdy miejsce wiązania pomaga w wiązaniu liganda z dużą cząsteczką.
