Kluczowa różnica między motywem a domeną polega na tym, że motyw nie jest niezależnie stabilny, podczas gdy domena jest niezależnie stabilna.
Białka są ważnymi biologicznymi makrocząsteczkami obecnymi w naszym ciele. Z drugiej strony kod genetyczny genu decyduje o sekwencji aminokwasowej białka. Ponadto białka mają strukturę pierwszorzędową, drugorzędową i trzeciorzędową. Struktura pierwszorzędowa to sekwencja aminokwasowa łańcucha polipeptydowego. Kiedy łańcuchy polipeptydowe fałdują się ze sobą, tworzą drugorzędową strukturę białka. Do struktur drugorzędowych należą helisy alfa, arkusze beta i struktury nad-drugorzędowe. Pewne grupy elementów nadrzędnych są znane jako motywy białkowe. Trzeciorzędowa struktura białka odnosi się do jego trójwymiarowej struktury, która decyduje o funkcji białka. Domena jest zwiniętym fragmentem cząsteczki białka, który jest kulisty i pełni dyskretną funkcję. Jest to podstawowa funkcjonalna i trójwymiarowa struktura białka.
Co to jest Motyw?
Motif to pewna grupa super drugorzędowych elementów białek, takich jak alfa helisy i struktury beta. Są to pewnego rodzaju wzorce obecne w różnych białkach. Motywy opisują wzory fałdowania drugorzędowych elementów strukturalnych i ich interakcje. Te wzory fałdowania stabilizują się dzięki podobnym wiązaniom, które są obecne w strukturach trzeciorzędowych. Nie są one jednak tak złożone jak struktury trzeciorzędowe.
Rysunek 01: Motyw
Są to proste kombinacje drugorzędowych struktur białek. Motyw sam w sobie nie jest stabilny. Ponadto motywy wyjaśniają strukturę białka, ale nie przewidują funkcji białka. Przykładami motywów białkowych są motyw beta-alfa-beta, motyw klucza greckiego, beczka beta, motyw beta-meander itp.
Co to jest domena?
Domena jest podstawową, funkcjonalną i trójwymiarową jednostką białka. Pełni określoną funkcję. Pojedyncze białko może mieć kilka odrębnych domen. Każda domena jest niezależną jednostką. Jest to struktura kulista. Odpowiada za określoną funkcję lub interakcję. Domeny można wykorzystać do postawienia hipotezy o funkcji niescharakteryzowanego białka. Analizując białko, należy wziąć pod uwagę, ponieważ domeny są funkcjonalnymi jednostkami białka.
Rysunek 02: Trzy różne domeny kinazy pirogronianowej
Domeny to bardzo stabilne i zwarte struktury. Można je łatwo odróżnić od innych regionów. Kinaza pirogronianowa ma trzy odrębne domeny, jak pokazano na figurze 02. Długość domeny może być różna, a średnia długość wynosi 100 aminokwasów. Każda domena zawiera hydrofobowy rdzeń zbudowany z drugorzędowych jednostek strukturalnych. Kilka domen wspólnie tworzy trzeciorzędową strukturę białka.
Jakie są podobieństwa między motywem a domeną?
- Motyw i domena to jednostki obecne w samych cząsteczkach białka.
- Są przydatne przy klasyfikowaniu rodzin białek.
Jaka jest różnica między motywem a domeną?
Motyw to pewna grupa nadrzędnych elementów białek, takich jak struktury alfa helisy i beta, podczas gdy domena jest jednostką funkcjonalną białka. Ponadto motyw jest strukturą drugorzędową, podczas gdy domena odpowiada za trzeciorzędową strukturę białka. Co więcej, domena jest samodzielną jednostką, w przeciwieństwie do motywu. Ponadto domena przedstawia funkcję białka, podczas gdy motyw nie. To główne różnice między motywem a domeną. Poniższa infografika przedstawia różnicę między motywem a domeną w formie tabelarycznej.
Podsumowanie – motyw kontra domena
Motyw to układ struktur drugorzędowych cząsteczki białka. W przeciwieństwie do domeny zwykle nie jest ona stabilna. Domena to niezależnie stabilna struktura białka. Dlatego może to być część lub cała cząsteczka białka. Jest to trójwymiarowa podstawowa jednostka funkcjonalna białka. Ponadto pełni funkcję i jest samodzielną jednostką. Motyw może być częścią domeny. Ale domena nie może być częścią motywu. To jest różnica między motywem a domeną.
