Kluczowa różnica – DNA w górę i w dół łańcucha
Ważne jest posiadanie ogólnej wiedzy na temat składu i struktury DNA, aby zrozumieć różnicę między DNA w górę i w dół. DNA składa się z łańcuchów polinukleotydowych. Nukleotydy to elementy budulcowe, które tworzą łańcuchy polinukleotydowe, a każdy nukleotyd składa się z trzech składników: pięciowęglowego cukru, zasady azotowej i grupy fosforanowej. Grupa fosforanowa i grupa OH są przyłączone odpowiednio do węgla w pozycji 5' i węgla w pozycji 3' cząsteczki cukru w nukleotydzie. Nukleotydy są połączone wiązaniami fosfodiestrowymi utworzonymi między grupą fosforanową 5’ jednego nukleotydu a grupą 3’ OH sąsiedniego nukleotydu. Jeśli łańcuch polinukleotydowy ma wolną grupę fosforanową 5', jest przypisywany jako koniec 5'; jeśli ma wolną grupę 3’ OH, przypisuje się ją jako koniec 3’. Dlatego nici DNA mają zwykle końce 5' i 3' zgodnie z pozycjami końcowymi łańcuchów polinukleotydowych. DNA istnieje również w postaci dwuniciowej. Dwie nici są do siebie antyrównoległe. Dlatego DNA ma dwie nici, które biegną w kierunku 5’ do 3’ i 3’ do 5’. DNA „upstream” i „downstream” odnosi się do transkrypcji i syntezy nici mRNA od 5’ do 3’. Jeśli DNA jest rozważane w kierunku 5 końca nici kodującej od miejsca inicjacji transkrypcji, jest znane jako DNA powyżej. Jeśli DNA jest rozważane w kierunku końca 3' od nici kodującej z miejsca inicjacji transkrypcji, jest znane jako DNA w dół. To jest kluczowa różnica między DNA upstream i downstream.
Co to jest DNA Upstream?
Gen jest dziedziczną jednostką strukturalną i funkcjonalną, która znajduje się na DNA organizmu. Jest przechowywany wraz z instrukcjami do skonstruowania białka. Gen ma specyficzny region cząsteczki DNA. W razie potrzeby transkrybuje i przekłada się na białko poprzez syntezę nici mRNA. Zwykle nić kodująca genu biegnie od kierunku 5’ do 3’. Kiedy jest transkrybowany, wytwarza nić mRNA w tym samym kierunku od 5’ do 3’. Podczas transkrypcji nić antysensowna od 3’ do 5’ służy jako nić matrycowa i inicjuje syntezę mRNA. W genie znajduje się miejsce inicjacji transkrypcji. W odniesieniu do miejsca inicjacji transkrypcji, region DNA w kierunku końca 5' nici kodującej jest znany jako DNA powyżej. Promotor genu jest zwykle zlokalizowany w górnym regionie DNA. W genach eukariotycznych znajdują się kasety TATA, proksymalne elementy promotora i wzmacniacze w obszarze powyżej genu. Region górny genu określany jest liczbami ujemnymi. DNA poprzedzające gen ma ogromne znaczenie dla transkrypcji.
Co to jest DNA Downstream?
Miejsce inicjacji transkrypcji jest znane jako +1 punkt genu. Region DNA od punktu +1 w kierunku końca 3' nici kodującej jest znany jako DNA w dół. Innymi słowy, poniżej genu znajduje się miejsce inicjacji transkrypcji w kierunku końca 5' nici matrycy. Dlatego DNA w dół regionu genu zawiera jednostkę transkrypcyjną i inne sekwencje, takie jak sekwencja terminatora. Promotor może wpływać na sekwencję w dół genu. Dalsza część genu jest określana liczbami dodatnimi. DNA poniżej genu to rzeczywisty region, który daje produkt białkowy.
Rysunek 01: DNA w górę i w dół
Jaka jest różnica między DNA Upstream i Downstream?
DNA w górę i w dół |
|
| Region DNA w kierunku końca 5’ sekwencji kodującej od miejsca inicjacji transkrypcji jest znany jako DNA powyżej. | Region DNA w kierunku końca 3’ nici kodującej od miejsca inicjacji transkrypcji jest znany jako DNA poniżej. |
| Elementy | |
| Promotory i wzmacniacze znajdują się w górnym łańcuchu DNA | Jednostka transkrypcyjna i sekwencje terminatora znajdują się w dalszym DNA. |
| Numerowanie | |
| Nukleotydy w górnym obszarze są określane liczbami ujemnymi | Nukleotydy są określane liczbami dodatnimi. |
| Funkcja | |
| Ten region zawiera elementy niezbędne do regulacji i zainicjowania transkrypcji | Ten region zawiera instrukcję produkcji białka i zakończenia transkrypcji |
Podsumowanie – DNA w górę i w dół
Łatwo jest zidentyfikować przed i za nicią RNA. W odniesieniu do miejsca odniesienia, region w kierunku końca 5' nici RNA jest znany jako RNA w górę, podczas gdy region w kierunku końca 3 'jest znany jako RNA w dół. Jednak w DNA są dwie nici biegnące w obu kierunkach 5’ do 3’ i 3’ do 5’. Stąd różnica między DNA w górę i w dół jest skomplikowana. W związku z tym jest różnicowany w odniesieniu do transkrypcji genu. Od miejsca inicjacji transkrypcji w kierunku końca 5 nici sensownej region DNA jest znany jako DNA w górę, podczas gdy od miejsca inicjacji transkrypcji w kierunku końca 3' nici sensownej jest znany jako DNA w dół. To jest różnica między DNA w górę i w dół.
