Kluczowa różnica między NAAT a PCR polega na tym, że NAAT jest metodą amplifikacji materiału genetycznego na kilka sposobów, w tym reakcję łańcuchową polimerazy, przemieszczenie nici lub amplifikację za pośrednictwem transkrypcji, podczas gdy PCR jest metodą amplifikacji materiału genetycznego przy użyciu wyłącznie cykl termiczny.
Pathogeny są identyfikowane głównie przez amplifikację ich materiału genetycznego. Większość technik w tym obszarze koncentruje się na wykrywaniu materiału genetycznego patogenu poprzez amplifikację określonych sekwencji w czasie rzeczywistym. Dlatego wyniki są uzyskiwane bardzo szybko w kontekście diagnostycznym. NAAT, PCR, biosensor i LCR to kilka technik stosowanych w laboratoriach do amplifikacji materiału genetycznego patogenu.
Co to jest NAAT?
Test amplifikacji kwasów nukleinowych (NAAT) to metoda w biologii molekularnej, która amplifikuje materiał genetyczny na kilka sposobów, takich jak reakcja łańcuchowa polimerazy, amplifikacja z przesunięciem nici lub amplifikacja za pośrednictwem transkrypcji. Amplifikację materiału genetycznego można również przeprowadzić za pomocą technik, takich jak reakcja łańcuchowa ligacji i reakcja rozgałęzionego DNA (quantiplex b DNA) w procedurze NAAT. NAAT wykorzystuje specyfikę parowania zasad Watsona-Cricka. W procedurze NAAT jednoniciowa sonda lub cząsteczka startera jest hybrydyzowana z docelową cząsteczką DNA lub RNA. Dlatego też konstrukcja nici sondy ma duże znaczenie dla zwiększenia czułości i specyficzności wykrywania. Następnie kolejny etap NAAT amplifikuje materiał genetyczny, wykonując wiele jego kopii w celu wykrycia.
Rysunek 01: NAAT
NAAT jest obecnie stosowana do wykrywania kilku patogenów, takich jak Neisseria gonorrhea, Chlamydia trachomatis, Mycobacterium tuberculosis i SARS-COV2. Ponadto opracowano test NAAT, aby skrócić okres okna. Okres okienkowy to okres pomiędzy momentem zakażenia pacjenta a pojawieniem się pozytywnego wyniku w testach na przeciwciała. Ponadto metoda przesiewowa NAAT została po raz pierwszy zatwierdzona w 1999 roku przez FDA. NAAT ma wiele zalet, w tym wykrywanie niskich poziomów DNA lub RNA, wysoką czułość i wysoką specyficzność.
Co to jest PCR?
PCR to metoda biologii molekularnej, która wzmacnia materiał genetyczny przy użyciu wyłącznie cykli termicznych. PCR oznacza reakcję łańcuchową polimerazy. Jest to test do wykrywania materiału genetycznego określonego organizmu, takiego jak bakterie, grzyby i wirusy. W diagnostyce choroby PCR wykrywa obecność patogenu, jeśli osoba ma patogen w momencie testu. W diagnostyce choroby protokół PCR składa się z kilku etapów, w tym pobierania próbek, ekstrakcji DNA, PCR i sekwencjonowania. W badaniu patogenów pobrana próbka służy do ekstrakcji materiału genetycznego (DNA lub RNA). Procedura PCR wymaga specjalnych chemikaliów, starterów i enzymów w celu wytworzenia milionów kopii materiału genetycznego wewnątrz maszyny PCR zwanej termocyklerem. Po amplifikacji z produktu PCR można wykryć patogen. Naukowcy używają specjalnego oprogramowania do interpretacji wyników.
Rysunek 02: PCR
Ponadto, obecnie w badaniach stosuje się różne rodzaje PCR. RT-PCR, Multiplex PCR, RAPD i Nested PCR to kilka z nich. PCR jest przydatny zwłaszcza w wykrywaniu zapalenia gardła (paciorkowcowe zapalenie gardła), atypowego zapalenia płuc (Chlymydia pneumoniae), odry (Morbillivirus), zapalenia wątroby (HBV) i wrzodziejącego zakażenia układu moczowo-płciowego (Haemophilus ducreyi).
Jakie są podobieństwa między NAAT a PCR?
- NAAT i PCR to dwie ważne metody biologii molekularnej stosowane do amplifikacji materiału genetycznego.
- Kwasy nukleinowe (DNA lub RNA) są amplifikowane obiema technikami.
- Są to techniki szybkie i szybkie.
- Obie techniki są obecnie używane do diagnozowania chorób.
- Są drogie niż metody konwencjonalne.
Jaka jest różnica między NAAT a PCR?
NAAT to metoda w biologii molekularnej, która amplifikuje materiał genetyczny przy użyciu kilku metod, podczas gdy PCR to metoda w biologii molekularnej, która amplifikuje materiał genetyczny przy użyciu wyłącznie cykli termicznych. NAAT wykorzystuje różne techniki amplifikacji materiału genetycznego, takie jak reakcja łańcuchowa polimerazy, amplifikacja z przemieszczeniem nici, amplifikacja za pośrednictwem transkrypcji, reakcja łańcuchowa ligacji i reakcja rozgałęzionego DNA (quantiplex b DNA). Z drugiej strony, PCR wykorzystuje różne techniki amplifikacji materiału genetycznego, takie jak RT-PCR. Multiplex PCR, RAPD, Nested PCR. To jest więc kluczowa różnica między NAAT a PCR.
Poniższa infografika przedstawia różnice między NAAT i PCR w formie tabelarycznej do bezpośredniego porównania.
Podsumowanie – NAAT vs PCR
Istnieją różne narzędzia biologii molekularnej używane w laboratoriach do wzmacniania materiału genetycznego. NAAT, PCR, biosensor i LCR to kilka takich technik. NAAT to technika biologii molekularnej, która amplifikuje materiał genetyczny na kilka sposobów, takich jak reakcja łańcuchowa polimerazy, przemieszczenie nici lub amplifikacja za pośrednictwem transkrypcji. PCR to metoda w biologii molekularnej, która amplifikuje materiał genetyczny za pomocą cykli termicznych. Jest to więc kluczowa różnica między NAAT a PCR.
